Question

我正在尝试使用

在Linux机器上安装一些R软件包

R CMD INSTALL -l <ourRlibrarylocation> <path where I saved the packagename.tar.gz file>

我看到一条错误消息：

ERROR: a 'NAMESPACE' file is required

我正在使用R 3.0.1。请帮助，我是R的新手，刚刚为客户下载了这些软件包。

一个例子：

 R CMD INSTALL -l /abcde/R/R-3.0.0/library /home/RFILES/PKG/UScensus2000tract_0.03.tar.gz
* installing *source* package âUScensus2000tractâ ...
ERROR: a 'NAMESPACE' file is required
* removing â/abcde/R/R-3.0.0/library/UScensus2000tractâ

Answer 1

According to the R documentation for writing extensions，所有发往3.0.0及更高版本的软件包都必须包含NAMESPACE文件。如果您下载的R软件包会出现上述错误，那么您应该尝试以下操作：

解开包裹：

tar -xvf the_package.tar.gz

添加NAMESPACE行exportPattern( "." )：

cd the_package
echo 'exportPattern( "." )' > NAMESPACE
cd ..

重新打开包裹：

tar -zcf the_package.tar.gz the_package

尝试重新安装。

希望有所帮助。

Answer 2

我实际上在编译R-3.0.1时遇到了同样的问题。它看起来是我使用的包版本已过时。这是针对proto：

# /var/local/R-3.0.1/bin/R CMD INSTALL -l /var/local/R-3.0.1/lib64/R/library proto_0.3-9.2.tar.gz
* installing *source* package ‘proto’ ...
ERROR: a 'NAMESPACE' file is required
* removing ‘/var/local/R-3.0.1/lib64/R/library/proto’

但有一个较新版本的proto（0.3-10）工作正常：

# ../var/local/R-3.0.1/bin/R CMD INSTALL -l ../var/local/R-3.0.1/lib64/R/library proto_0.3-10.tar.gz
* installing *source* package ‘proto’ ...
** package ‘proto’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘proto.Rnw’
   ‘protoref.Rnw’
** testing if installed package can be loaded
* DONE (proto)

我有一个较旧的R（2.15）安装版本，旧的原型包与之配合使用：

# /var/local/R-2.15.0/bin/R CMD INSTALL -l /var/local/R-2.15.0/lib64/R/library proto_0.3-9.2.tar.gz
* installing *source* package 'proto' ...
** Creating default NAMESPACE file
** R
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   'proto.Rnw'
   'protoref.Rnw'
** testing if installed package can be loaded

看起来R的旧版本实际上会创建缺少的NAMESPACE文件，但新版本会失败。希望这能帮到你！

Answer 3

我发现以下链接更有用： How should I deal with "package 'xxx' is not available (for R version x.y.z)" warning?

<强> 6。包裹已过期

可能是archived（如果不再维护，不再通过R CMD check次测试）。

在这种情况下，您可以使用install_version()
加载旧版本的软件包
library(devtools)
install_github("cran/foobarbaz")
另一种方法是从github CRAN镜像安装。
{{1}}

Answer 4

现在可以使用remotes::install_url()或remotes::install_local()。

它会安装依赖项并自动生成NAMESPACE文件。

错误：需要“NAMESPACE”文件

4 个答案: