Question

我正在尝试构建一个R包，以便阅读CRAN上的手册。我可以弄清楚使用导入来加载命名空间中的函数将是在Description文件中使用的最佳选择。添加到描述文件后，我还将其添加到命名空间文件中。我使用所需的函数将importFrom添加到命名空间文件中。

现在，当我在我的包装上运行R CMD检查时，我得到一个错误

不需要命名空间依赖项： 'GGPLOT2'

更多信息：即使我将包添加到描述文件中的Depends中，它们也不会被加载。

请帮忙解决这个问题。

请在下面找到我的描述文件

Package: bigpackage
Type: Package
Title: Some title
Version: 1.0
Date: 2012-10-25
Author: Mayank Bansal
Maintainer: somename
Imports : R(>= 2.15.1), SweaveListingUtils( >=0.5.5),xtable(>=1.7-0),
        brew(>=1.0-6), knitr(>=0.8), RHive(>= 0.0-6), ggplot2(>=0.9.2)
        , brew, knitr
SystemRequirements : LaTeX(texi2dvi) must be present in the system to
        create PDF reports
Description: Some Description
License: file LICENSE
LazyLoad: yes
ByteCompile: true
OS_type : unix

Answer 1

如果您在NAMESPACE文件中使用import或importFrom，则应在DESCRIPTION文件的Imports部分中为该包提供一个条目（除非您有需要使用的原因取决于在这种情况下，包应该有一个Depends中的条目，而不是Imports）

以下是Writing R Extensions

的相关部分

“Imports”字段列出从其导入名称空间的包（在NAMESPACE文件中指定）但不需要附加的包。 “::”和“:::”运算符访问的命名空间必须在此处列出，或者在“建议”或“增强”中列出（见下文）。理想情况下，此字段将包含所有使用的标准软件包，并且包含使用S4的软件包很重要（因为它们的类定义可以更改，而DESCRIPTION文件用于决定在发生这种情况时要重新安装的软件包）。在“Depends”字段中声明的包不应该也在“Imports”字段中。

我创建了一个包含单个函数f的包。我创建了一个NAMESPACE文件，其中包含您所说的importFrom行。{/ p>

NAMESPACE文件

export("f")
importFrom("ggplot2","ggplot","geom_histogram")

此时，如果我按预期运行R CMD check，则会收到错误消息：

不需要命名空间依赖：'ggplot2'

但是，如果我将Imports: ggplot2添加到DESCRIPTION中，以便我的DESCRIPTION文件如下所示，它会毫无问题地传递R CMD check。

说明文件

Package: anRpackage
Type: Package
Title: What the package does (short line)
Version: 1.0
Date: 2012-11-07
Author: Me
Maintainer: Who to complain to <yourfault@somewhere.net>
Description: More about what it does (maybe more than one line)
License: GPL
Imports: ggplot2

Answer 2

发生这种情况的一个简单原因是，如果在任何/所有函数中声明@import时不小心使用逗号

例如

#'
#' @import rvest, dplyr, stringr, jsonlite
#'
#' @export
#'

将对此进行更改

#'
#' @import rvest dplyr stringr jsonlite
#'
#' @export
#'

这是一个常见错误，因为软件包用逗号分隔在DESCRIPTION文件中

不需要命名空间依赖项

2 个答案: