从序列中提取基因

时间:2013-06-18 22:12:34

标签: string r dna-sequence

我在R中有一个对象,它保存了一系列的基因和序列。

$`140545`

[1] 

"GAAACATCCGAGGCTGGAGTGAGCCACGCGGAGGAGGAAGAACAGCCCGAGCTCACAGGGGCGGGGAAGAGTTCTAGCTCGCGACAGCCC"

$`57187`

[1] 

"CGGGCAGAGACGCTCCTCACTTTCCAGACTGGGCAGCCAGGCAGAGGGGCTCCTCACATCCCAGACGATGGGCGGCCAGGCAGAGAGGCTC"

我想只将id存储在一个对象中。例如,我将如何在R

中实现它
[1] 140545

[2] 57187

我对R

非常陌生

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

ids <- names(your_list_object)

但请注意,ID将保存为字符。因此,如果您想要数字化,则可能必须使用ids <- as.numeric(names(your_list_object))

此外,R通常提供了许多从对象中提取“名称”属性的简单方法。例如,看看?姓名,?rownames,?colnames,?dimnames等。