Question

我在大型EC2 Ubuntu实例上运行R 2.9，加载了RAM，但没有终端。当我加载具有显示依赖项的库（例如sqldf包）时，我收到以下错误：

library(sqldf)
...
Loading required package: tcltk
Loading Tcl/Tk interface ... Error in fun(...) : couldn't connect to display "localhost:11.0"
Error : .onLoad failed in 'loadNamespace' for 'tcltk'
Error: package 'tcltk' could not be loaded

这似乎是一个普遍的问题，我想知道其他人是如何解决它的。安装X11服务器不是理想的解决方案。

Answer 1

使用虚拟帧缓冲X11服务器 - 我们也是这样做来构建需要X11的软件包，用于无头chroots中的R版本。以此为例构建的部分取决于rggobi：

xvfb xauth xfonts-base

安装完成后，您可以使用xvfb-run命令。如果您通过例如

启动R.

xvfb-run R --no-save

您现在应该能够使用需要X11的例程和命令，例如一些绘图设备，或者tcl / tk初始化也坚持使用X11。

同样的技巧对Web服务器很有用。

Answer 2

如果你能控制服务器，那么Dirk的建议确实很有效。可以运行xvfb。如果没有，请继续阅读......

在较新版本的R（＆gt; = 2.10＆amp;也许更早）中，这不再是错误，这是一个警告：

> library(tcltk)
Loading Tcl/Tk interface ... done
Warning message:
In fun(libname, pkgname) : no DISPLAY variable so Tk is not available

您现在可以通过以下方式禁止此警告和后续程序包加载消息：

> suppressPackageStartupMessages(suppressWarnings(library(tcltk)))

由于加载了qvalue这样取决于tcltk的包，您通常会看到此消息。如果你是在沉默操作之后，你应该首先默默地加载tcltk，然后是感兴趣的包：

> suppressPackageStartupMessages(suppressWarnings(library(tcltk)))
> library(qvalue)

标记

由于：http://dev.list.galaxyproject.org/wrapping-qvalue-in-Galaxy-td4655164.html

而复活

如何在没有X11的服务器上运行R，并避免破坏依赖性

2 个答案: