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Question

我正在尝试编写一个在多个IPython引擎中执行的函数。该函数将pandas Series作为参数。该系列的每个元素都是一个字符串，整个系列构成了TF.IDF计算的语料库。

在阅读了IPython并行文档和一些教程之后，它似乎非常简单，我想出了以下内容：

import pandas as pd
from IPython.parallel import Client


def calculemus(corpus):
    from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer

    vectorizer = TfidfVectorizer(min_df=1, stop_words='english')

    return vectorizer.fit_transform(corpus)


review = pd.read_csv('review.csv')['text']
review = review.fillna('')

client = Client()

r = client[-1].apply(calculemus, review).get()

但是我收到了这个错误：

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)/xxx/site-packages/IPython/zmq/serialize.pyc in unpack_apply_message(bufs, g, copy)
    154                     sa.data = m.bytes
    155 
--> 156     args = uncanSequence(map(unserialize, sargs), g)
    157     kwargs = {}
    158     for k in sorted(skwargs.iterkeys()):
/xxx/site-packages/IPython/utils/newserialized.pyc in unserialize(serialized)
    175 
    176 def unserialize(serialized):
--> 177     return UnSerializeIt(serialized).getObject()
/xxx/site-packages/IPython/utils/newserialized.pyc in getObject(self)
    159                 buf = self.serialized.getData()
    160                 if isinstance(buf, (bytes, buffer, memoryview)):
--> 161                     result = numpy.frombuffer(buf, dtype = self.serialized.metadata['dtype'])
    162                 else:
    163                     raise TypeError("Expected bytes or buffer/memoryview, but got %r"%type(buf))
ValueError: cannot create an OBJECT array from memory buffer

我不确定问题是什么，有人可以启发我吗？

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显然这个错误确切地说明了它的内容。如果我这样做：

r = client[-1].apply(calculemus, np.array(review, dtype=str)).get()

它有点工作。

所以下一个问题是，这是IPython的功能还是限制？

Answer 1

这是IPython 0.13中的一个错误，应该在master中修复。序列化numpy数组有一种特殊情况可以避免复制数据，这种行为是由isinstance(numpy.ndarray)检查触发的。这是不合适的，因为isinstance捕获了包含pandas对象的子类，但是那些pandas对象（以及一般的数组子类）应该以相同的方式处理 not ，因为元数据将丢失而另一方的重建往往会失败。

PS：

r = client[-1].apply(calculemus, np.array(review, dtype=str)).get()

相当于

r = client[-1].apply_sync(calculemus, np.array(review, dtype=str))

IPython.parallel ValueError：无法从内存缓冲区创建OBJECT数组

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1 个答案:

PS：