Question

我正在尝试使用knitr中的ggmap库包含地图：

library(ggmap)
murder = subset(crime, offense='murder')
qmplot(lon, lat, data=murder)

它在knitr之外运行良好，但当我尝试在knitr中运行此代码块时，我收到错误：

UseMethod（“depth”）中的错误：没有适用于“NULL”类的对象的“深度”方法

最终PDF中没有地图

我尝试将qmplot行包装在evaluate（...）中，但这不起作用

图书馆的输出（knitr）; sessionInfo（）

> library(knitr)
> sessionInfo()
version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: i686-redhat-linux-gnu (32-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5]   LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8      
 [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C               
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  utils     datasets  grDevices methods   base     

other attached packages:
[1] knitr_1.2      vimcom_0.9-8   setwidth_1.0-3

loaded via a namespace (and not attached):
[1] digest_0.6.3   evaluate_0.4.3 formatR_0.7    stringr_0.6.2  tools_3.0.1

我也试过通过Rscript运行相同的代码（即不是从VIM内部），但是：

Rscript -e "library(knitr); knit('map.Rnw')"

我得到了类似的错误：

Error in UseMethod("depth") : 
no applicable method for 'depth' applied to an object of class "NULL"
Calls: knit ... grid.draw -> grid.draw.gTableChild -> upViewport -> depth

使用ggmap v 2.3和ggplot v 0.9.3.1

Answer 1

我发现了问题：我正在使用tikz设备将地图包含在我的最终文档中。 tikz设备似乎不适用于地图（或至少更大的地图）。

当我将设备更改为pdf或png时，地图已包含在我的文档中，没有任何问题。

Answer 2

在调用长ggplot命令时遇到此错误（R3.4.1），并在大型数据帧（28x32000）上附加了许多附加命令

ggplot(z, aes(x=T,y=A,fill=F), title="D") + geom_bar(aes(fill=F), stat ="identity", position="dodge",  colour="black") + facet_grid(P~T,scales='free_x',space='free_x')
+ theme(strip.text.y = element_text(angle = 0), axis.text.x = element_text(angle = 270)) + guides(col=guide_legend(ncol=1))

分离出命令解决了这个问题，并且可以说，提高了可读性：

z2 <- ggplot(z, aes(x=T,y=A,fill=F), title="D")
z2 <- z2 + geom_bar(aes(fill=F), stat ="identity", position="dodge",  colour="black")
z2 <- z2 + facet_grid(P~T,scales='free_x',space='free_x')
z2 <- z2 + theme(strip.text.y = element_text(angle = 0), axis.text.x = element_text(angle = 270))
z2 <- z2 + guides(col=guide_legend(ncol=1))
z2

想知道这是否是与（命令大小）*（对象大小）相关的更一般的错误？

编辑：当调整绘图窗口的大小时，对ggplot2的较小命令重新发现此错误 - 可能更大，时间密集型任务更可能以这种方式中断 - 或者再次，可能是内存问题。

使用knitr包含ggmap

2 个答案: