我有一个函数调用(到jags.parallel
),当给定像n.iter = 100
这样的数字参数时,它会起作用,但当参数使用变量值n.iter = n.iter
时失败。这似乎可能是jags.parallel
错误的最小可重现示例:
library(R2jags)
model.file <- system.file(package="R2jags", "model", "schools.txt")
J <- 8.0
y <- c(28.4,7.9,-2.8,6.8,-0.6,0.6,18.0,12.2)
sd <- c(14.9,10.2,16.3,11.0,9.4,11.4,10.4,17.6)
jags.data <- list("y","sd","J")
jags.params <- c("mu","sigma","theta")
jags.inits <- function(){
list("mu"=rnorm(1),"sigma"=runif(1),"theta"=rnorm(J))
}
然后这个有效:
jagsfit.p <- jags.parallel(data=jags.data, inits=jags.inits, jags.params,
n.iter=5000, model.file=model.file)
但这不是:
n.iter=5000
jagsfit.p <- jags.parallel(data=jags.data, inits=jags.inits, jags.params,
n.iter=n.iter, model.file=model.file)
给出错误:
Error in checkForRemoteErrors(lapply(cl, recvResult)) :
3 nodes produced errors; first error: object 'n.iter' not found
我认为这与未将变量n.iter
导出到集群有关,但不清楚并行引擎jags.parallel使用的是什么。在将n.iter
传递给函数之前,有没有办法欺骗R来评估{{1}}?
答案 0 :(得分:3)
do.call()
是一个很棒的朋友,因为(来自?do.call
):
如果&#39;引用&#39;是&#39; FALSE&#39;,默认值,然后是参数 评估(在呼叫环境中,不在&#39; envir&#39;)。
我确认以下情况有效,通过结果对象的打印方式显示的所有数字生成与jagsfit.p
匹配的结果:
jagsfit.p2 <- do.call(jags.parallel,
list(data=jags.data, inits=jags.inits, jags.params,
n.iter=n.iter, model.file=model.file))