组装由DNA测序产生的片段（通常称为读取）的一种方法是寻找包含给定读数组的所有读段的最短公共超弦。该问题的一个模型是重建模型，其计算可能的超弦（包含所有片段）与每个片段之间的最小编辑距离。我还不明白的是，在计算给定片段的编辑距离时，有必要计算该片段反向补码的编辑距离。
片段及其反向补语的示例可以是：
ACTGTCC片段
TGACAGG补体（我们知道的互补链）
GGACAGT反向补充
根据我正在阅读的书，它背后的意思是找到一个尽可能短的超弦，要么给定的片段或其反向补码必须是超弦的近似子串。我知道许多数学/计算模型对于他们解决生物学问题的方式没有生物学意义，但是我认为这种重建模型在生物学上是合理的，可以找到包含DNA特定区域的所有片段的字符串。序列和所有补体片段，毕竟在组装时我们可以找到两个链序列。但是反向补充不是给定序列存在的东西，除非它遇到某种断裂 - 重组事件，这是不期望的，主要是在谈论保守区域时。你知道为什么这个模型会考虑反向补充吗？提前谢谢。