在编译包quantreg时,lapack没有链接

时间:2013-04-24 13:17:59

标签: r lapack quantreg

quantreg无法安装,因为它没有链接到lapack:

install.packages("quantreg")

[剪断]

gcc -std=gnu99 -shared -o quantreg.so akj.o boot.o brute.o chlfct.o cholesky.o combos.o crq.o crqfnb.o dsel05.o etime.o extract.o idmin.o iswap.o kuantile.o mcmb.o penalty.o powell.o rls.o rq0.o rq1.o rqbr.o rqfn.o rqfnb.o rqfnc.o rqs.o sparskit2.o srqfn.o srqfnc.o srtpai.o -L/home/myself/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/Rcpp/lib -lRcpp -Wl,-rpath,/home/myself/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/Rcpp/lib -lprofiler -lgfortran -lm -lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR

[剪断]

unable to load shared object '/home/myself/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/quantreg/libs/quantreg.so':
/home/myself/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/quantreg/libs/quantreg.so: undefined symbol: dposv_

奇怪的是,当从头开始创建一个新用户时,一切都很完美(并且日志中有一个“-llapack”)。

我怀疑一些环境变量要对此负责,但无法确定哪一个:当取消设置LIBRARY_PATH和LD_LIBRARY_PATH时,这仍然会发生。谢谢你的任何想法!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我在.R中有一个包含

的makevars文件
PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` -lprofiler