Question

我是使用MPI的初学者。在这里，我写了一个非常简单的程序来测试MPI是否可以运行。这是我的hello.c：

#include <stdio.h>
#include <mpi.h>

int main(int argc, char *argv[]) {
  int numprocs, rank, namelen;
  char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];

  MPI_Init(&argc, &argv);
  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
  MPI_Get_processor_name(processor_name, &namelen);
  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
  printf("Process %d on %s out of %d\n", rank, processor_name, numprocs);

  MPI_Finalize();
}

我用来节点测试，主机文件是：node1 node2

所以我有两台名为node1和node2的机器。我可以在没有密码的情况下互相交换。

我输入以下内容启动该程序：mpirun -np 2 -f hostfile ./hello。

可执行文件hello位于两台计算机的同一目录中。

然后在我跑步后，我收到一个错误：

PMPI_Barrier中的致命错误：其他MPI错误，错误堆栈： PMPI_Barrier（425）.........：MPI_Barrier（MPI_COMM_WORLD）失败 MPIR_Barrier_impl（331）....：集体失败 MPIR_Barrier_impl（313）....：MPIR_Barrier_intra（83）....： dequeue_and_set_error（596）：秩0的通信错误致命 PMPI_Barrier中的错误：其他MPI错误，错误堆栈： PMPI_Barrier（425）.........：MPI_Barrier（MPI_COMM_WORLD）失败 MPIR_Barrier_impl（331）....：集体失败 MPIR_Barrier_impl（313）....：MPIR_Barrier_intra（83）....： dequeue_and_set_error（596）：秩为1的通信错误

如果我注释掉MPI_Barrier（），它可以正常工作。看来机器之间的通信有问题吗？或者我没有正确安装openmpi？有什么想法吗？

我正在使用Ubuntu 12.10

我得到了一些提示：这在MPICH2中效果不好，如果我使用openmpi，那么它可以工作。我只是通过sudo apt-get install mpich2安装了MPICH。我错过了什么吗？ mpich2的大小远小于openmpi

Answer 1

在/ etc / hosts中，某些Linux发行版的较新版本会在文件顶部添加以下类型的行：

127.0.0.1 localhost
127.0.0.1 [hostname]

应更改此名称，以便主机名行包含您的实际IP地址。如果您不做出如下错误的更改，MPI hydra进程将中止：

Fatal error in PMPI_Barrier: Other MPI error, error stack:
PMPI_Barrier(425)...........: MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Barrier_impl(292)......: 
MPIR_Barrier_or_coll_fn(121): 
MPIR_Barrier_intra(83)......: 
dequeue_and_set_error(596)..: Communication error with rank 0

MPI_Barrier在Ubuntu中无法正常工作

1 个答案: