在Python中用scipy绘制树状图

Question

scipy dendrogram文档说：

dendrogram(Z, ...)
    The dendrogram illustrates how each cluster is
    composed by drawing a U-shaped link between a non-singleton
    cluster and its children. ...It is expected that the distances in Z[:,2] be
    monotonic, otherwise crossings appear in the dendrogram.

我不清楚关于“预计Z [：，2]中的距离是这样的句子”     单调，否则交叉出现在树形图中“？图中的交叉点是什么？有人可以举例说明特定距离矩阵发生这种情况并解释原因吗？

这是一个跨越的例子吗？在我看来，这只是由距离矩阵中的一些对称性引起的......

Answer 1

Z应该指定聚类的合并（合并2个聚类）和它们发生的“时间”，其中“时间”是树形图的y轴（这是它们的距离）。 Z通常被构造成使得“时间”按递增的顺序，这也使得易于绘制以使U形状不在彼此之上。如果您以不同的顺序绘制U，它们可能会相互重叠，看起来会混乱 - 这就是所谓的交叉。

我举了一个简短的例子，这是一个十字路口的例子：

底线：坚持正确的顺序。