Question

如何使用与现有矩阵相同的数据获取数据框？

我的矩阵的简化示例：

mat <- matrix(c(0, 0.5, 1, 0.1, 0.2, 0.3, 0.3, 0.4, 0.5),
              ncol = 3, nrow = 3,
              dimnames = list(NULL, c("time", "C_0", "C_1")))

> mat
     time C_0 C_1
[1,]  0.0 0.1 0.3
[2,]  0.5 0.2 0.4
[3,]  1.0 0.3 0.5

我想创建一个如下所示的数据框：

     name   time   val
1    C_0    0.0    0.1
2    C_0    0.5    0.2
3    C_0    1.0    0.3
4    C_1    0.0    0.3
5    C_1    0.5    0.4
6    C_1    1.0    0.5

我的所有尝试都非常笨拙，例如：

data.frame(cbind(c(rep("C_1", 3), rep("C_2", 3)),
                 rbind(cbind(mat[,"time"], mat[,"C_0"]),
                       cbind(mat[,"time"], mat[,"C_1"]))))

有没有人知道如何更优雅地做到这一点？请注意，我的实际数据还有一些列（40列）。

Answer 1

如果您将time列更改为行名称，则可以使用as.data.frame(as.table(mat))来处理此类简单案例。

示例：

> data <- c(0.1, 0.2, 0.3, 0.3, 0.4, 0.5)
> dimnames <- list(time=c(0, 0.5, 1), name=c("C_0", "C_1"))
> mat <- matrix(data, ncol=2, nrow=3, dimnames=dimnames)
> as.data.frame(as.table(mat))
  time name Freq
1    0  C_0  0.1
2  0.5  C_0  0.2
3    1  C_0  0.3
4    0  C_1  0.3
5  0.5  C_1  0.4
6    1  C_1  0.5

在这种情况下，时间和名称都是因素。您可能希望将时间转换回数字，或者可能无关紧要。

Answer 2

您可以使用基础包中的stack。但是，首先需要将矩阵强制转换为data.frame并在数据堆叠后对列重新排序。

mat <- as.data.frame(mat)
res <- data.frame(time= mat$time,stack(mat,select=-time))
res[,c(3,1,2)]

  ind time values
1 C_0  0.0    0.1
2 C_0  0.5    0.2
3 C_0  1.0    0.3
4 C_1  0.0    0.3
5 C_1  0.5    0.4
6 C_1  1.0    0.5

请注意，stack通常比reshape2包更有效。

Answer 3

reshape2 包中的

melt()让您关闭......

library(reshape2)
(res <- melt(as.data.frame(mat), id="time"))
#   time variable value
# 1  0.0      C_0   0.1
# 2  0.5      C_0   0.2
# 3  1.0      C_0   0.3
# 4  0.0      C_1   0.3
# 5  0.5      C_1   0.4
# 6  1.0      C_1   0.5

...虽然您可能希望对其结果进行后期处理，以获得您首选的列名称和订购。

setNames(res[c("variable", "time", "value")], c("name", "time", "val"))
#   name time val
# 1  C_0  0.0 0.1
# 2  C_0  0.5 0.2
# 3  C_0  1.0 0.3
# 4  C_1  0.0 0.3
# 5  C_1  0.5 0.4
# 6  C_1  1.0 0.5

Answer 4

使用dplyr和tidyr：

library(dplyr)
library(tidyr)

df <- as_data_frame(mat) %>%      # convert the matrix to a data frame
  gather(name, val, C_0:C_1) %>%  # convert the data frame from wide to long
  select(name, time, val)         # reorder the columns

df
# A tibble: 6 x 3
   name  time   val
  <chr> <dbl> <dbl>
1   C_0   0.0   0.1
2   C_0   0.5   0.2
3   C_0   1.0   0.3
4   C_1   0.0   0.3
5   C_1   0.5   0.4
6   C_1   1.0   0.5

Answer 5

我发现以下情况＆＃34;作弊＆＃34;工作非常整洁，没有错误

> dimnames <- list(time=c(0, 0.5, 1), name=c("C_0", "C_1"))
> mat <- matrix(data, ncol=2, nrow=3, dimnames=dimnames)
> head(mat, 2) #this returns the number of rows indicated in a data frame format
> df <- data.frame(head(mat, 2)) #"data.frame" might not be necessary

Et瞧！

从矩阵创建数据框

5 个答案: