Question

我正在使用matplotlib.pyplot.contourf（）函数生成一个字段轮廓图。调用函数的参数是：

contourf(xvec,xvec,w,levels,cmap=matplotlib.cm.jet)

，其中

xvec = numpy.linspace(-3.,3.,50)
levels = numpy.linspace(-0.01,0.25,100)

而w是我的数据。

结果图在屏幕上看起来相当不错，但是当我使用对matplotlib.pyplot.savefig（）的调用保存为pdf时，生成的pdf有很多别名（我认为就是这样）。对savefig的调用只是savefig('filename.pdf')。我尝试过使用dpi参数，但没有运气。致电matplotlib.get_backend()会吐出'TkAgg'。

我将附加一个保存为pdf的图形，与保存为png的图形（类似于屏幕上的图像）相比较，以证明问题：

没有别名：https://dl.dropbox.com/u/6042643/wigner_g0.17.png

pdf with aliasing：https://dl.dropbox.com/u/6042643/wigner_g0.17.pdf

如果我有任何其他细节可以帮助您给出答案，请告诉我。我应该提一下，保存为.eps会产生与保存到pdf类似的糟糕结果。但pdf表明问题更加清晰。我的目标是最终获得生产质量。我可以将其附在乳胶文件上，作为科学论文发表。如果我能找到一种能产生令人满意的效果的方法，我会很乐意在一种格式下保存，然后转换它。

最佳，

·阿尔

Answer 1

在使用@pelson的有用答案一段时间之后，我终于找到了解决这个长期问题的正确解决方案（目前在Matplotlib 2.0中），它不需要多次调用轮廓或光栅化图形。

我参考原始答案here以获得更广泛的解释和示例。

总之，解决方案包括以下几行：

cnt = plt.contourf(x, y, z)

for c in cnt.collections:
    c.set_edgecolor("face")

plt.savefig('test.pdf')

Answer 2

我不知道pdf中的轮廓如此糟糕。你是对的，我认为matplotlib之外的PDF渲染器正在消除轮廓。出于这个原因，我认为您需要特别小心使用哪种应用程序来查看生成的PDF - 我见过的最佳行为是GIMP，但我确信还有很多其他观众表现良好。

要解决此问题（使用GIMP查看PDF时），我能够“栅格化”使用matplotlib生成的轮廓，以避免出现难看的白线问题：

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np


xs, ys = np.mgrid[0:30, 0:40]
data = (xs - 15) ** 2 + (ys - 20) ** 2 + (np.sin(ys) + 10) ** 2

cs = plt.contourf(xs, ys, data, 60, cmap='jet')

# Rasterize the contour collections
for c in cs.collections:
    c.set_rasterized(True)

plt.savefig('test.pdf')

这产生了一个轮廓图，没有表现出你所展示的问题。

另一种可能更好的替代方法是通过在轮廓f下面放置彩色线来欺骗抗锯齿。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np


xs, ys = np.mgrid[0:30, 0:40]
data = (xs - 15) ** 2 + (ys - 20) ** 2 + (np.sin(ys) + 10) ** 2

# contour the plot first to remove any AA artifacts
plt.contour(xs, ys, data, 60, cmap='jet', lw=0.1)
cs = plt.contourf(xs, ys, data, 60, cmap='jet')

plt.savefig('test.pdf')

我应该注意，如果我将数字保存为“.ps”而不是“.pdf”，我就不会看到这些问题 - 也许这是第三种选择。

希望这可以帮助您让论文准确地了解您的需求。

将matplotlib填充的等高线图保存为.pdf或.eps时的别名

2 个答案: