Question

我正在尝试使用system2（）从R中调用一个简单的python脚本。我已经阅读了一些我发现含糊不清的信息说如果使用'太多'内存，它将无法正常工作。

如果我加载一个大型数据集并使用其中的一些信息作为参数传递给system2（），那么只有在我调用Rstudio中手动点击“Restart R”时它才有效。

我想要的是什么：

df <- read.csv('some_large_file.csv')
###extracting some info called 'args_vec'
for(arg in args_vec){
    system2('python', args)
}

这不会按原样运作。简单地传递for循环。

我需要什么：

df <- read.csv('some_large_file.csv')
###extracting some info called 'args_vec'
###something that 'restarts' R
for(arg in args_vec){
    system2('python', args)
}

This answer并不能得到我想要的东西。也就是说，它在Rstudio中对我不起作用，并且它称为“系统”（在这种情况下它表现出与“system2”相同的问题）。事实上，当我把上面引用的答案放在我的Rprofile.site文件中时，它只是立即关闭了rstudio：

我尝试将该建议作为正常功能（而不是使用“makeActiveBinding”，并且它没有完全奏效。

##restart R in r session  -- doesn't work
makeActiveBinding("refresh", function() { system("R --save"); q("no") }, .GlobalEnv)

##nor did this:
refresh <- function() { system("R --save"); q("no") }

我尝试了上面这两个选项的多种变体，但这对于一个简单的问题感觉很长。关于启动过程还有很多我还不了解，“makeActiveBinding”有点神秘。有人能指出我正确的方向吗？

Answer 1

在Rstudio中，您可以通过以下方式重新启动R会话：

command/ctrl + shift + F10

您也可以使用：

.rs.restartR()

Answer 2

RStudio有这个没有文档的rs.restartR()，应该这样做：重启R。

但是，它不会卸载已加载的软件包，也不会清理环境，因此我对是否重新启动R有一些疑问。

Answer 3

您是否尝试在apply函数中嵌入函数调用，而不是for循环？

我有一些代码片段在for循环中运行系统内存完全与apply一起运行。这可能有帮助吗？

Answer 4

如果使用RStudio，请使用菜单项“会话”>“重新启动R”或相关的键盘快捷键Ctrl+Shift+F10（对于Windows和Linux）或Command+Shift+F10（对于Mac OS）。其他键盘快捷键使您可以轻松地从中断的地方重新开始开发，例如说“重新运行所有代码，直到此处”：

在R脚本中，使用Ctrl+Alt+B（Windows和Linux）或Command+Option+B（Mac OS）在R降价中，使用Ctrl+Alt+P（在Windows和Linux中）或Command+Option+P（在Mac OS中）如果从外壳运行R，请使用Ctrl+D或q()退出，然后重新启动R。

在Rstudio中重新启动R.

4 个答案: