Question

我正在尝试从一个大文件中绘制一些数据。数据具有以下形式：

0.025876 139 0
0.030881 140 0
0.030982 141 0
0.035602 142 0
0.035521 143 0
0.038479 144 0
0.040668 145 0
0.040121 146 0
0.037953 147 0
0.039027 148 0
0.038338 149 0
0.047557 139 1
0.045105 140 1
0.044943 141 1
0.042370 142 1
0.042025 143 1
0.038946 144 1
0.037953 145 1
0.033373 146 1
0.030070 147 1
0.029118 148 1
0.025552 149 1

原则上，每一行都对应一个三维点，我只是“简单地”想要绘制一个从这些点生成的三维表面，就像我可以用gnuplot中的splot函数做的那样，对于那些了解它的人

上网查找我的问题的答案，我尝试使用matplolib轮廓函数进行以下操作：

#!/usr/bin/python

from numpy import *
import pylab as p
import sys
import mpl_toolkits.mplot3d.axes3d as p3

 s = str(sys.argv[1])
 f = open(s)
 z,y,x = loadtxt(f, unpack = True)
 f.close
 #x = [1,2,3]
 #y = [1,2,3]
 #z = [1,8,16]
 data = zip(x,y,z)

 #map data on the plane
 X, Y = meshgrid(arange(0, 89, 1), arange(0, 300, 1))
 Z = zeros((len(X),len(Y)),'Float32')
 for x_,y_,z_ in data:
   Z[x_, y_] = z_ #this should work, but only because x and y are integers
             #and arange was done with a step of 1, starting from 0

 fig=p.figure()
 ax = p3.Axes3D(fig)
 ax.contourf(X,Y,Z)
 ax.set_xlabel('X')
 ax.set_ylabel('Y')
 ax.set_zlabel('Z')
 p.show()

这段代码实际上很好地处理了向量x，y和z，并在上面的代码中用＃标签进行了注释。

但是知道我正在尝试上面给出的数据，我在matplotlib中得到“输入x和y必须是1D或2D”错误。

我读过这可能与Z与X或Y形状不一样的事实有关......但我不知道如何处理这个问题。

顺便说一句，正如你可能已经意识到的那样，我是Python的超级新手，如果代码对你们中的某些人来说非常难看，我会道歉。

无论如何，我们非常欢迎任何帮助。

谢谢！

法比安

Answer 1

使用scipy.interpolate.griddata：

import io
import sys
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import mpl_toolkits.mplot3d.axes3d as axes3d
import scipy.interpolate as interpolate

content = '''0.025876 139 0
0.030881 140 0
0.030982 141 0
0.035602 142 0
0.035521 143 0
0.038479 144 0
0.040668 145 0
0.040121 146 0
0.037953 147 0
0.039027 148 0
0.038338 149 0
0.047557 139 1
0.045105 140 1
0.044943 141 1
0.042370 142 1
0.042025 143 1
0.038946 144 1
0.037953 145 1
0.033373 146 1
0.030070 147 1
0.029118 148 1
0.025552 149 1'''

data = np.genfromtxt(io.BytesIO(content), dtype=None, names='x, y, z')

# Or, to read from a file:
# data = np.genfromtxt(filename, dtype=None, names='x, y, z')

x, y, z = data['x'], data['y'], data['z']
N = 20
xi = np.linspace(x.min(), x.max(), N)
yi = np.linspace(y.min(), y.max(), N)

X, Y = np.meshgrid(xi, yi)
Z = interpolate.griddata((x, y), z, (X, Y), method='nearest')

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1, 1, 1, projection='3d')
ax.scatter(data['x'], data['y'], data['z'])
ax.plot_wireframe(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1)
# ax.plot_surface(X, Y, Z)
plt.show()

产量

enter image description here

matplotlib中的“输入x和y必须是1D或2D”错误

1 个答案: