Question

道歉，如果这个问题已经得到解答，但所有信息都已得到解答。我能够找到与自己合并数据帧或以不同方式合并的方法。我真的很感激任何想法。

我有一个非常大但非常简单的数据框，大约有。 22500行和48列。我想基于行名称合并数据框中的一些行，我想知道是否有任何方法可以做到这一点。

数据框的一部分如下所示：

                         Treatment1 Treatment2 Treatment3 Treatment4 Treatment5
    Nasvi2EG000001t1         28         43         33         25         64
    Nasvi2EG000002t2          0          3          0          0          4
    Nasvi2EG000002t5          0          0          0          0          0
    Nasvi2EG000002t6          0          0          0          0          0
    Nasvi2EG000004t1          1          0          0          0          0
    Nasvi2EG000009t1          0          4          2          0          4
    Nasvi2EG000013t1         21          8         17         19          7
    Nasvi2EG000014t1          0          3          0          0          4
    Nasvi2EG000014t2          0          4          0          0          3

正如您所看到的，行2,3和4的名称相同，直到“t”之后的数字，与第8行和第9行相同。我想将类似命名的行合并在一起......

我想最终得到的是：

                     Treatment1 Treatment2 Treatment3 Treatment4 Treatment5
    Nasvi2EG000001t1         28         43         33         25         64
    Nasvi2EG000002            0          3          0          0          4
    Nasvi2EG000004t1          1          0          0          0          0
    Nasvi2EG000009t1          0          4          2          0          4
    Nasvi2EG000013t1         21          8         17         19          7
    Nasvi2EG000014            0          7          0          0          7

将已合并的行中的值相加。

非常感谢任何想法。

谢谢！

Answer 1

假设您的data.frame被称为“SODF”，请从row.names创建一个向量，从row.names的末尾删除“t + some digit”并将其用作你的聚合变量。

> aggvar <- gsub("(t[0-9]+$)", "", rownames(SODF))
> aggregate(. ~ aggvar, SODF, sum)
          aggvar Treatment1 Treatment2 Treatment3 Treatment4 Treatment5
1 Nasvi2EG000001         28         43         33         25         64
2 Nasvi2EG000002          0          3          0          0          4
3 Nasvi2EG000004          1          0          0          0          0
4 Nasvi2EG000009          0          4          2          0          4
5 Nasvi2EG000013         21          8         17         19          7
6 Nasvi2EG000014          0          7          0          0          7

基于row.names合并数据帧中的行

1 个答案: