我有两个数据集应该是相同的大小但不是。我需要修剪A中不在B中的值,反之亦然,以消除进入报告的图形中的噪声。 (别担心,这些数据没有被永久删除!)
我已阅读以下内容:
但是我仍然无法使其正常工作。这是我的代码:
bg2011missingFromBeg <- setdiff(x=eg2011$ID, y=bg2011$ID)
#attempt 1
eg2011cleaned <- subset(eg2011, ID != bg2011missingFromBeg)
#attempt 2
eg2011cleaned <- eg2011[!eg2011$ID %in% bg2011missingFromBeg]
第一次尝试只是消除了生成的setdiff向量中的第一个值。第二次尝试产生并且笨拙的错误:
Error in `[.data.frame`(eg2012, !eg2012$ID %in% bg2012missingFromBeg)
: undefined columns selected
答案 0 :(得分:64)
这会给你你想要的东西:
eg2011cleaned <- eg2011[!eg2011$ID %in% bg2011missingFromBeg, ]
第二次尝试中的错误是因为您忘记了,
通常,为方便起见,规范object[index]
子集为2d object
的列。如果要对行进行子集并保留所有列,则必须使用该规范
object[index_rows, index_columns]
,而index_cols
可以留空,默认情况下会使用所有列。
但是,您仍需要包含,
以表示您希望获取行的子集而不是列的子集。
答案 1 :(得分:16)
如果您真的只想通过两个数据框中存在的索引对每个数据框进行子集化,则可以使用“匹配”功能执行此操作,如下所示:
data_A[match(data_B$index, data_A$index, nomatch=0),]
data_B[match(data_A$index, data_B$index, nomatch=0),]
但这与:
相同data_A[data_A$index %in% data_B$index,]
data_B[data_B$index %in% data_A$index,]
这是一个演示:
# Set seed for reproducibility.
set.seed(1)
# Create two sample data sets.
data_A <- data.frame(index=sample(1:200, 90, rep=FALSE), value=runif(90))
data_B <- data.frame(index=sample(1:200, 120, rep=FALSE), value=runif(120))
# Subset data of each data frame by the index in the other.
t_A <- data_A[match(data_B$index, data_A$index, nomatch=0),]
t_B <- data_B[match(data_A$index, data_B$index, nomatch=0),]
# Make sure they match.
data.frame(t_A[order(t_A$index),], t_B[order(t_B$index),])[1:20,]
# index value index.1 value.1
# 27 3 0.7155661 3 0.65887761
# 10 12 0.6049333 12 0.14362694
# 88 14 0.7410786 14 0.42021589
# 56 15 0.4525708 15 0.78101754
# 38 18 0.2075451 18 0.70277874
# 24 23 0.4314737 23 0.78218212
# 34 32 0.1734423 32 0.85508236
# 22 38 0.7317925 38 0.56426384
# 84 39 0.3913593 39 0.09485786
# 5 40 0.7789147 40 0.31248966
# 74 43 0.7799849 43 0.10910096
# 71 45 0.2847905 45 0.26787813
# 57 46 0.1751268 46 0.17719454
# 25 48 0.1482116 48 0.99607737
# 81 53 0.6304141 53 0.26721208
# 60 58 0.8645449 58 0.96920881
# 30 59 0.6401010 59 0.67371223
# 75 61 0.8806190 61 0.69882454
# 63 64 0.3287773 64 0.36918946
# 19 70 0.9240745 70 0.11350771
答案 2 :(得分:3)
真的人类易于理解的示例(因为这是我第一次使用%in%),如何比较两个数据框并仅保留特定列中包含相等值的行:
# Set seed for reproducibility.
set.seed(1)
# Create two sample data frames.
data_A <- data.frame(id=c(1,2,3), value=c(1,2,3))
data_B <- data.frame(id=c(1,2,3,4), value=c(5,6,7,8))
# compare data frames by specific columns and keep only
# the rows with equal values
data_A[data_A$id %in% data_B$id,] # will keep data in data_A
data_B[data_B$id %in% data_A$id,] # will keep data in data_b
结果:
> data_A[data_A$id %in% data_B$id,]
id value
1 1 1
2 2 2
3 3 3
> data_B[data_B$id %in% data_A$id,]
id value
1 1 5
2 2 6
3 3 7
答案 3 :(得分:2)
根据对原始帖子的评论,合并/连接非常适合此问题。特别是,内部联接将仅返回两个数据框中存在的值,从而不需要setdiff
语句。
使用Dinre的例子中的数据:
在基地R:
cleanedA <- merge(data_A, data_B[, "index"], by = 1, sort = FALSE)
cleanedB <- merge(data_B, data_A[, "index"], by = 1, sort = FALSE)
使用dplyr包:
library(dplyr)
cleanedA <- inner_join(data_A, data_B %>% select(index))
cleanedB <- inner_join(data_B, data_A %>% select(index))
要将数据保存为两个单独的表,每个表只包含自己的变量,这会将不需要的表子集设置为仅在其加入之前的索引变量。然后,没有新的变量添加到结果表中。