提交Grid Engine作业时缺少Java库

Question

当我测试运行java程序的脚本时，我收到此错误：

  

线程“main”中的异常java.lang.UnsatisfiedLinkError：/usr/java/jdk1.6.0_16/jre/lib/amd64/xawt/libmawt.so:libXtst.so.6：无法打开共享对象文件：否这样的文件或目录       at java.lang.ClassLoader $ NativeLibrary.load（Native Method）       在java.lang.ClassLoader.loadLibrary0（ClassLoader.java:1778）       在java.lang.ClassLoader.loadLibrary（ClassLoader.java:1674）       在java.lang.Runtime.load0（Runtime.java:770）       在java.lang.System.load（System.java:1003）       at java.lang.ClassLoader $ NativeLibrary.load（Native Method）       在java.lang.ClassLoader.loadLibrary0（ClassLoader.java:1778）       在java.lang.ClassLoader.loadLibrary（ClassLoader.java:1695）       在java.lang.Runtime.loadLibrary0（Runtime.java:823）       在java.lang.System.loadLibrary（System.java:1028）       at sun.security.action.LoadLibraryAction.run（LoadLibraryAction.java:50）       at java.security.AccessController.doPrivileged（Native Method）       在java.awt.Toolkit.loadLibraries（Toolkit.java:1592）       在java.awt.Toolkit。（Toolkit.java:1614）       在java.awt.Font。（Font.java:210）       在savant.settings.BrowserSettings。（BrowserSettings.java:37）       at savant.util.NetworkUtils.getSeekableStreamForURI（NetworkUtils.java:185）       在savant.data.sources.BAMDataSource。（BAMDataSource.java:62）       在IReckon.WholeGenomeExecution.main（WholeGenomeExecution.java:208）

但是，当我进入节点并运行脚本时，我没有收到错误。

我正在运行这样的qsub：qsub -cwd -V

也许我需要设置一些环境变量，但不会-V处理它？<​​/ p>

Answer 1

libXtst.so.6位于该系统的哪个位置？

网格引擎最有可能使用与您手动登录时不同的LD_LIBRARY_PATH。 看起来有点奇怪。

对于Grid Engine使用，我还建议避免使用AWT。