使用bc或其他标准实用程序的任意数量的标准偏差

时间:2013-02-26 23:16:01

标签: bash variables standard-deviation

是否有一些技巧可以让人们使用bc(或其他一些标准实用程序)来返回任意数量的数字的标准偏差?为方便起见,假设数字以下列方式存储在Bash变量中:

myNumbers="0.556
1.456
45.111
7.812
5.001"

所以,我正在寻找的答案将采用以下形式:

standardDeviation="$(echo "${myNumbers}" | <insert magic here>)"

5 个答案:

答案 0 :(得分:11)

使用

standardDeviation=$(
    echo "$myNumbers" |
        awk '{sum+=$1; sumsq+=$1*$1}END{print sqrt(sumsq/NR - (sum/NR)**2)}'
)
echo $standardDeviation

使用

#!/usr/bin/env perl

use strict; use warnings;
use Math::NumberCruncher;

my @data = qw/
    0.556
    1.456
    45.111
    7.812
    5.001
/;

print Math::NumberCruncher::StandardDeviation(\@data);

输出

16.7631

答案 1 :(得分:5)

人口标准差:

jq -s '(add/length)as$a|map(pow(.-$a;2))|add/length|sqrt'
ruby -e'a=readlines.map(&:to_f);puts (a.map{|x|(x-a.reduce(:+)/a.length)**2}.reduce(:+)/a.length)**0.5'
jq -s '(map(.*.)|add/length)-pow(add/length;2)|sqrt'
awk '{x+=$0;y+=$0^2}END{print sqrt(y/NR-(x/NR)^2)}'

awk中,^在POSIX中,但**不在。 **gawk支持nawk,但mawk不支持length

示例标准差(前两个命令与上面的前两个命令相同,但length-1已替换为jq -s '(add/length)as$a|map(pow(.-$a;2))|add/(length-1)|sqrt' ruby -e'a=readlines.map(&:to_f);puts (a.map{|x|(x-a.reduce(:+)/a.length)**2}.reduce(:+)/(a.length-1))**0.5' R -q -e 'sd(scan("stdin"))' ):

std::function

答案 2 :(得分:4)

或者使用GNU Octave(它可以比简单的std更多):

standardDeviation="$(echo "${myNumbers}" | octave --eval 'disp(std(scanf("%f")))')"
echo $standardDeviation

输出

18.742

答案 3 :(得分:1)

假设:

$ myNumbers=$(echo "0.556 1.456 45.111 7.812 5.001" | tr " " "\n")

首先确定您是否需要sample standard deviation vs population standard deviation这些数字。

人口标准差(Excel中的函数STDEV.P)需要整个数据填充。在Excel中,将跳过文本或空格。

awk

中可以轻松计算出来
$ echo "$myNumbers" | awk '$1+0==$1 {sum+=$1; sumsq+=$1*$1; cnt++}
                           END{print sumsq/cnt; print sqrt(sumsq/cnt - (sum/cnt)**2)}'
16.7631

Ruby

$ echo "$myNumbers" | ruby -e 'arr=$<.read.split(/\s/).map { |e| Float(e) rescue nil }.compact
                             sumsq=arr.inject(0) { |acc, e| acc+=e*e }
                             p (sumsq/arr.length - (arr.sum/arr.length)**2)**0.5'
16.76307799182477

对于样本标准差(Excel中的函数STDEV.S并忽略文本或空白)您需要先收集整个样本,因为对样本中的每个值使用均值。

awk

$ echo "$myNumbers" | 
     awk 'function sdev(array) {
     for (i=1; i in array; i++)
        sum+=array[i]
     cnt=i-1
     mean=sum/cnt
     for (i=1; i in array; i++)  
        sqdif+=(array[i]-mean)**2
     return (sqdif/(cnt-1))**0.5
     }
     $1+0==$1 {sum1[++cnt]=$1} 
     END {print sdev(sum1)}' 
18.7417

或者在Ruby中:

$ ruby -lane 'BEGIN{col1=[]}
            col1 << Float($F[0]) rescue nil
            END {col1.compact
                 mean=col1.sum / col1.length
                 p (col1.inject(0){ |acc, e| acc+(e-mean)**2 } / 
                        (col1.length-1))**0.5
              }' <(echo "$myNumbers")
18.741690950925424

答案 4 :(得分:0)

只是为了好玩,8 年后,使用 gnuplot

echo "${myNumbers}" | gnuplot -e 'stats "-" nooutput; print STATS_stddev'
16.7630779918248

作为解释,我让 gnuplot 对其 stats 上的数据运行 stdin 函数,抑制正常输出并仅打印标准偏差。


相关,但不是答案的一部分……您还可以生成许多其他统计数据,例如中值、峰态和偏斜、四分位数、最大值、最小值,如下所示:

echo "${myNumbers}" | gnuplot -e 'stats "-"'

样本输出

* FILE: 
  Records:           5
  Out of range:      0
  Invalid:           0
  Header records:    0
  Blank:             0
  Data Blocks:       1

* COLUMN: 
  Mean:              11.9872
  Std Dev:           16.7631
  Sample StdDev:     18.7417
  Skewness:           1.4125
  Kurtosis:           3.1303
  Avg Dev:           13.2495
  Sum:               59.9360
  Sum Sq.:         2123.4687

  Mean Err.:          7.4967
  Std Dev Err.:       5.3010
  Skewness Err.:      1.0954
  Kurtosis Err.:      2.1909

  Minimum:            0.5560 [0]
  Maximum:           45.1110 [2]
  Quartile:           1.4560 
  Median:             5.0010 
  Quartile:           7.8120