好的,这很奇怪。我怀疑这是data.table
中的一个错误,但是如果有人能解释为什么会发生这种情况会有用,那么update
究竟做了什么?
我在list(list())
内使用data.table
技巧来存储拟合模型。当您为不同的分组创建lm
个对象序列,然后update
这些模型时,所有模型的模型数据将成为最后一个分组的模型数据。这似乎是一个参考文献悬挂在应该制作副本的地方,但我找不到哪里,我无法在lm
和update
之外重现这一点。
具体示例:
从虹膜数据开始,首先使三种不同的样本大小,然后将lm
模型拟合到每个物种,更新这些模型:
set.seed(3)
DT = data.table(iris)
DT = DT[rnorm(150) < 0.9]
fit = DT[, list(list(lm(Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Length))),
by = Species]
fit2 = fit[, list(list(update(V1[[1]], ~.-Sepal.Length))), by = Species]
原始数据表中每个物种的数量不同
DT[,.N, by = Species]
# Species N
# 1: setosa 41
# 2: versicolor 39
# 3: virginica 42
第一次合适证实了这一点:
fit[, nobs(V1[[1]]), by = Species]
# Species V1
# 1: setosa 41
# 2: versicolor 39
# 3: virginica 42
但更新后的第二个适合所有型号显示42
fit2[, nobs(V1[[1]]), by = Species]
# Species V1
# 1: setosa 42
# 2: versicolor 42
# 3: virginica 42
我们还可以查看包含用于拟合的数据的model属性,并查看所有模型确实使用了最终的组数据。问题是这是怎么发生的?
head(fit$V1[[1]]$model)
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length
# 1 5.1 3.5 1.4
# 2 4.9 3.0 1.4
# 3 4.7 3.2 1.3
# 4 4.6 3.1 1.5
# 5 5.0 3.6 1.4
# 6 5.4 3.9 1.7
head(fit$V1[[3]]$model)
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length
# 1 6.3 3.3 6.0
# 2 5.8 2.7 5.1
# 3 6.3 2.9 5.6
# 4 7.6 3.0 6.6
# 5 4.9 2.5 4.5
# 6 7.3 2.9 6.3
head(fit2$V1[[1]]$model)
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length
# 1 6.3 3.3 6.0
# 2 5.8 2.7 5.1
# 3 6.3 2.9 5.6
# 4 7.6 3.0 6.6
# 5 4.9 2.5 4.5
# 6 7.3 2.9 6.3
head(fit2$V1[[3]]$model)
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length
# 1 6.3 3.3 6.0
# 2 5.8 2.7 5.1
# 3 6.3 2.9 5.6
# 4 7.6 3.0 6.6
# 5 4.9 2.5 4.5
# 6 7.3 2.9 6.3
答案 0 :(得分:4)
这不是答案,但是评论太长了
对于每个结果模型,术语组件的.Environment
是相同的
e1 <- attr(fit[['V1']][[1]]$terms, '.Environment')
e2 <- attr(fit[['V1']][[2]]$terms, '.Environment')
e3 <- attr(fit[['V1']][[3]]$terms, '.Environment')
identical(e1,e2)
## TRUE
identical(e2, e3)
## TRUE
data.table
似乎正在使用相同的位内存(我的非技术术语)
按组j
的每次评估(这是有效的)。但是,当调用update
时,它正在使用它来重新构建模型。这将包含最后一组的值。
所以,如果你捏造它,那就可以了
fit = DT[, { xx <-list2env(copy(.SD))
mymodel <-lm(Sepal.Length ~ Sepal.Width + Petal.Length)
attr(mymodel$terms, '.Environment') <- xx
list(list(mymodel))}, by= 'Species']
lfit2 <- fit[, list(list(update(V1[[1]], ~.-Sepal.Width))), by = Species]
lfit2[,lapply(V1,nobs)]
V1 V2 V3
1: 41 39 42
# using your exact diagnostic coding.
lfit2[,nobs(V1[[1]]),by = Species]
Species V1
1: setosa 41
2: versicolor 39
3: virginica 42
不是长期解决方案,但至少是一种解决方法。