使用data.table对分组数据进行插值

时间:2013-08-10 18:58:30

标签: r interpolation data.table linear-interpolation

这是我最初发布的问题的延续 http://r.789695.n4.nabble.com/subset-between-data-table-list-and-single-data-table-object-tp4673202.html。马修曾建议我在这里发表我的问题所以我现在正在这样做。

这是我在下面的输入:

library(data.table)
library(pracma) # for the interp1 function


 tempbigdata1 <- data.table(c(14.80, 14.81, 14.82), c(7900, 7920, 7930),   c("02437100", "02437100", "02437100"))

 tempbigdata2 <- data.table(c(9.98, 9.99, 10.00), c(816, 819, 821),  c("02446500", "02446500", "02446500"))

 tempbigdata3 <- data.table(c(75.65, 75.66, 75.67), c(23600, 23700, 23800), c("02467000", "02467000", "02467000"))

  tempsbigdata <- rbind(tempbigdata1, tempbigdata2, tempbigdata3)

  setnames(tempsbigdata,c("y", "x", "site_no"))

  setkey(tempsbigdata, site_no)

tempsbigdata
   y        x       site_no
1: 14.80    7900        02437100
2: 14.81    7920        02437100
3: 14.82    7930        02437100
4:  9.98    816         02446500
5:  9.99    819         02446500
6: 10.00    821         02446500
7: 75.65    23600       02467000
8: 75.66    23700       02467000
9: 75.67    23800       02467000


 aimsmall <- data.table(c("02437100", "02446500", "02467000"), c(3882.65, 819.82, 23742.37), c(1830.0, 382.0, 10400.0))

 setnames(aimsmall,c("site_no", "mean", "p50"))

 setkey(aimsmall, site_no)

aimsmall
    site_no     mean    p50
1: 02437100     3882.65     1830
2: 02446500     819.82      382
3: 02467000     23742.37    10400

我使用此代码使用tempsbigdata$y的{​​{1}}值生成插值aimsmall$mean

site_no

这是函数 meanpre <- tempsbigdata[,if(aimsmall$mean > min(tempsbigdata$x){ interp1(tempsbigdata$x, tempsbigdata$y, xi = aimsmall$mean, method ="linear")},by=site_no] 的输出,但不正确。

meanpre

这是我想要的:

meanpre
    site_no        V1
1: 02437100     12.07599
2: 02437100     9.99410
3: 02437100     19.56813
4: 02446500     12.07599
5: 02446500     9.99410
6: 02446500     19.56813
7: 02467000     12.07599
8: 02467000     9.99410
9: 02467000     19.56813

有什么建议吗?谢谢。

更新1:

休,我过去使用过近似函数,对我的数据不准确;但是,meanpre site_no V1 1: 02446500 9.99 2: 02467000 75.66 中的interp1函数是准确的。 pracma&amp;中的meanp50aimsmall中的x值是放电值。 tempsbigdata中的y代表量具高度。我使用tempsbigdata函数来确定放电值的适当量具高度或interp1值,或y(以及mean)。

弗兰克,谢谢您的建议和建议的代码。这是您建议的代码的输出:

p50

当我运行以下代码时,我得到以下结果:

tempsbigdata[aimsmall][,if(mean[1] > min(x)){interp1(tempsbigdata$x,tempsbigdata$y, xi = aimsmall$mean, method ="linear")},by=site_no]


site_no       V1
1: 02446500 12.07599
2: 02446500  9.99410
3: 02446500 75.66424
4: 02467000 12.07599
5: 02467000  9.99410 
6: 02467000 75.66424

有没有办法得到这个回报?谢谢。

 interp1(tempsbigdata$x, tempsbigdata$y, xi = aimsmall$mean, method ="linear")


 [1] 12.07599  9.99410 75.66424

更新2

弗兰克,谢谢你,我添加了代码,以便更容易在R中获取数据.Pracma是一个R包的数值方法例程,从GNU Octave [类似于MATLAB(R)]移植到R. site_no V1 1: 02446500 9.99 2: 02467000 75.66 函数是一维插值函数。

弗兰克,这很完美(关于“做东西”的R代码的最后评论):

interp1

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