包含poweRlaw的多个幂律图

时间:2013-02-24 09:31:04

标签: r plot power-law

我尝试使用包poweRlaw绘制一些powerlaw fit。它似乎适用于单曲线。但我无法在同一图表上绘制多个图。 Ref:这个包里有办法吗? [附注:我是新手]

set.seed(1)
x1 <- ceiling(rlnorm(1000, 4))

x2 <- ceiling(rlnorm(1000, 2))

library(poweRlaw)

pl_d = pl_data$new(x1)
plot(pl_d)

#Now fit the powerlaw
m = displ$new(pl_d)
#Estimate the cut-off
#estimate_xmin(m)
aaa <- estimate_xmin(m)
aaa <- as.data.frame(aaa)
aaa <- aaa[2,1]
x_min <- min(table(x))
m$setXmin(aaa); m$mle()
#Plot the data and the PL line
#plot(m)
lines(m, col=2)

# next POWER LAW graph

#Plot the data
pl_d = pl_data$new(x2)
points(pl_d)

#Now fit the powerlaw
m = displ$new(pl_d)
#Estimate the cut-off
#estimate_xmin(m)
aaa <- estimate_xmin(m)
aaa <- as.data.frame(aaa)
aaa <- aaa[2,1]
x_min <- min(table(x))
m$setXmin(aaa); m$mle()
#Plot the data and the PL line
#points(m)
lines(m, col=3)

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您可以使用lines命令添加多个最佳拟合幂律。所以,使用你的数据:

set.seed(1)
x1 = ceiling(rlnorm(1000, 4))

我们加载包并创建一个离散的幂律对象:

m = displ$new(x1)

然后绘制数据

plot(m)

接下来,我们为每个幂律设置xminalpha,并使用lines将其添加到图表中:

m$setXmin(100)
p_100 = estimate_pars(m)
m$setPars(p_100)
lines(m, col=2, lwd=2)

##Line 2    
m$setXmin(202)
p_200 = estimate_pars(m)
m$setPars(p_200)
lines(m, col=3, lwd=2)

enter image description here


如果要在同一个图上有多个数据集,最简单的方法是绘制一个数据集,但将数据保存为数据帧。例如,生成一些数据集:

set.seed(1)
x1 = ceiling(rlnorm(1000, 4))
x2 = ceiling(rlnorm(1000, 5))

符合幂律

m1 = displ$new(x1)
m1$setXmin(estimate_xmin(m1))

m2 = displ$new(x2)
m2$setXmin(estimate_xmin(m2))

绘制数据集2,但将数据保存为pts2

pts2 = plot(m2)

正常绘制和添加行:

plot(m1)
points(pts2$x, pts2$y, col=3)
lines(m1, col=2)
lines(m2, col=4)

得到:

enter image description here