compileCode中的Rcpp内联包错误

时间:2013-02-18 15:15:22

标签: r inline rcpp

我安装了R以及这两个包Rcpp和内联。 (我正在做一个项目,包括加速R中一个痛苦缓慢的程序,我决定使用Rcpp)...我知道我做错了什么......可能错过了一步,但我无法弄明白。如果你正在阅读这篇文章,请向Dirk道具!感谢Rcpp和全新的内联软件包pdf,但......它还没有运行。 请注意我是新手。如前所述,我清理了所有其他软件包,只有R安装了Rcpp和内联(当然我也安装了c ++)。

    library(Rcpp)
    library(inline)
    x<-as.numeric(1:10)
    n<-as.integer(10)
    code<-"
    integer i 
    do 1 i=1, n(1)
    1 x(i)=x(i)**3
    "
    cubefn<-                       cfunction(signature(n="integer",x="numeric"),code,convention=".Fortran")
     ERROR(s) during compilation: source code errors or   compiler      configuration errors!
                Program source:
      1: #include <R.h>
      2: 
      3: 
      4: extern "C" {
      5:   void filef2424e34d61 ( int * n, double * x );
      6: }
      7: 
      8: void filef2424e34d61 ( int * n, double * x ) {
      9: 
     10: integer i
     11: do 1 i=1, n(1)
     12: 1 x(i)=x(i)**3
     13: 
     14: }
    Error in compileCode(f, code, language, verbose) : 
      Compilation ERROR, function(s)/method(s) not created! 
    In addition: Warning message:
    running command 'C:/R/R-2.15.2/bin/x64/R CMD SHLIB filef2424e34d61.cpp 2> filef2424e34d61.cpp.err.txt' had status 1 

如果是缺少包骨架的构造:我尝试了简单的rcpp_hello_world()示例:

    rcpp_hello_world <- function(){

    .Call( "rcpp_hello_world", PACKAGE = "mypackage" )
    }

    Folder PATH listing for volume OS
    Volume serial number is 769C-A616
    C:.

其余的是一长串奇怪的符号,但我能读到的是我所拥有的c ++项目的名称,我没有包含它们,因为它太长了

    rcpp_hello_world <-function(){

    .Call("rcpp_hello_world",PACKAGE="mypackage")

    }

    rcpp_hello_world()

    Error in .Call("rcpp_hello_world", PACKAGE = "mypackage") : 
      "rcpp_hello_world" not available for .Call() for package "mypackage"

任何事情都会有所帮助,我也安装了linux,所以如果这是一个更好的选择,请告诉我。我现在对任何事情持开放态度,最轻微的进步令人高兴

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

你真的安装了Fortran编译器吗?

如果您不知道,或者您不知道,请尝试使用您的Linux机器。如果要使用Rcpp和内联构建,则Windows 上的R必须能够编译源包。一个好的快速测试是尝试像

这样的东西
R> myroot <- cppFunction('double myroot(double x) { return ::sqrt(x); }')
R> myroot(16)
[1] 4
R> 

或等效地通过内联(其中rcppcxxfunction(..., plugin="Rcpp")调用的包装器,您需要最新的内联包)

R> myroot2 <- rcpp(signature(xs="numeric"), 
+                  body='double x=as<double>(xs); return wrap(::sqrt(x));')
R> myroot2(16)
[1] 4
R> 

如果这不起作用,请阅读安装Rtools for Windows等的R基础知识。我们在Rcpp FAQ中还有一些其他说明。