使用samr时R中的错误消息

时间:2013-02-12 14:32:20

标签: r runtime-error

我一直在R中使用SAM(微阵列的显着性分析),当我的程序运行时,在使用sam指令执行操作时它停止了。显示的消息是:

Cluster size 12488 broken into 6032 6456 
Cluster size 6032 broken into 2628 3404 
Cluster size 2628 broken into 1051 1577

在某些数据集中,它会显示这些消息,但处理仍然没有任何问题;而在其他人的节目挂起。 R不会显示任何消息,但显示Cluster破碎的消息是Rstudio。

我正在使用的sam指令类似于:

samfit <- SAM(t, numbas, resp.type="Two class unpaired",
                         nperms=100, 
                         testStatistic=c("standard"),
                         knn.neighbor=10, 
                         random.seed=1234567, 
                         logged2=TRUE,
                         genenames=rownames(t))

在没有使用s for R之前,是否有人遇到过这个错误?我在谷歌搜索过,但我还没有找到任何关于它的信息

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