“不对称”成对距离矩阵

Question

假设有三个序列需要比较：a，b和c。传统上，得到的3乘3成对距离矩阵是对称，表明从a到b的距离等于从b到a的距离。

我想知道TraMineR是否提供了一些产生非对称成对距离矩阵的方法。

Answer 1

不，TraMineR不会因Pat的评论中强调的原因而产生'不对称'的差异。

计算序列之间成对差异的主要兴趣是，一旦我们有这样的不同，我们可以例如

• 测量序列之间的差异，确定邻域，找到中间体，......
• 运行群集算法，自组织地图，MDS，......
• 对序列进行类似ANOVA的分析
• 为序列增加回归树

在这些过程中输入非对称差异矩阵很可能会产生不相关的结果。

正是由于这种对称性要求，用于计算最佳匹配距离的替换成本必须是对称的。重要的是不要将替代成本解释为从一种状态转换到另一种状态的成本，而是将它们理解为它们是什么，即编辑成本。例如，比较两个序列时 aabcc和aadcc，我们可以通过在第一个b中随意替换d或在d中替换b来使它们相等第二个。然后，如果不给两个替换的成本相同则没有意义。

希望这有帮助。