Question

我一直在使用带有R基础图形和tikz输出的knitr一段时间，并且想要试用ggplot2。但是，这个最小的例子无法使用knitr 1.0.5产生任何输出：

\documentclass{article}
\begin{document}
<<dev = 'tikz'>>=
library(ggplot2)
d = data.frame(a = c(1, 2, 3), b = c(4, 5, 6), c = c(7, 8, 9))
ggplot(d, aes(a, b, color = c)) + geom_point()
@
\end{document}

相反，它失败并显示消息Error in UseMethod("depth"): no applicable method for 'depth' applied to an object of class "NULL"。在R中执行代码或选择png设备将产生预期的图形。省略颜色美学或将c因子与tikzDevice一起使用，因此连续色标似乎是问题所在。

我做错了什么，或者那是一个错误？

Answer 1

我可以通过将tikzDevice添加到代码块的末尾来让dev.off()使用您的代码。例如：

cat("
    \\documentclass{article}
    \\begin{document}
    <<dev = 'tikz'>>=
    library(ggplot2)
    d = data.frame(a = c(1, 2, 3), b = c(4, 5, 6), c = c(7, 8, 9))
    ggplot(d, aes(a, b, color = c)) + geom_point()
    dev.off()
    @
    \\end{document}
", "test_works.Rtex")
knit("test_works.Rtex")

工作正常。

我还注意到如果通过（原始）代码上的活动R会话调用knit()，我会留下一个活跃的tikz设备......

cat("
    \\documentclass{article}
    \\begin{document}
    <<dev = 'tikz'>>=
    library(ggplot2)
    d = data.frame(a = c(1, 2, 3), b = c(4, 5, 6), c = c(7, 8, 9))
    ggplot(d, aes(a, b, color = c)) + geom_point()
    @
    \\end{document}
    ", file = "test_fails.Rtex")
knit("test_fails.Rtex")
dev.list()

Answer 2

这是一个bug，现在已经在tikzDevice的开发版本0.10中得到解决，很快就会遇到CRAN。在此之前，请使用

进行安装

devtools::install_github("yihui/tikzDevice")

ggplot2的连续色标是否与knitr的tikzDevice不兼容？

2 个答案: