无法使用plyr包并使用列表

时间:2013-01-21 13:21:30

标签: r plyr

我无法理解plyr包的用法。我尝试使用它来分割存储在列表中的数据帧,应用函数,将结果存储为数据帧,并将数据帧再次组合为列表。 所以给出以下数据:

    #create test dfs
    df1<-data.frame(a=sample(1:50,10),b=sample(1:50,10),c=sample(1:50,10),d=(c("a","b","c","a","a","b","b","a","c","d")))
    df2<-data.frame(a=sample(1:50,9),b=sample(1:50,9),c=sample(1:50,9),d=(c("e","f","g","e","e","f","f","e","g")))
    df3<-data.frame(a=sample(1:50,8),b=sample(1:50,8),c=sample(1:50,8),d=(c("h","i","j","h","h","i","i","h")))

    #make them a list
    list.1<-list(df1=df1,df2=df2,df3=df3)

我想计算每个数据帧的d中定义的每个组的平均值。 如果我只在一个数据帧上使用plyr(按组按特定列计算平均值),则使用plyr包的可能性为:

    ddply(df1,.(d),summarise, mean=mean(a))

但是如何将其应用于数据框中的每一列以及列表中的每个数据框?我如何重新编码所有数据,以便最终得到一个包含结果的matrizes列表?对不起这个非常基本的问题,但我是R的新手,我一直试图解决这个问题很长一段时间...... thx。

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您需要将所有数据放入一个大的data.frame

library(reshape)

big_dataframe = ldply(list.1, function(x) melt(x, id.vars = "d"))
> head(big_dataframe)
  .id d variable value
1 df1 a        a    44                                                      
2 df1 b        a    17                                                      
3 df1 c        a    15                                                      
4 df1 a        a    30                                                      
5 df1 a        a    49                                                      
6 df1 b        a    33

...然后在其上使用ddply

res = ddply(big_dataframe, .(.id, d, variable), summarise, mn = mean(value))
> res
   .id d variable       mn
1  df1 a        a 40.00000                                                  
2  df1 a        b 25.25000                                                  
3  df1 a        c 31.25000                                                  
4  df1 b        a 22.66667                                                  
5  df1 b        b 16.00000                                                  
6  df1 b        c 26.00000                                                  
7  df1 c        a  9.00000                                                  
8  df1 c        b 16.50000                                                  
9  df1 c        c 15.00000                                                  
10 df1 d        a 28.00000                                                  
11 df1 d        b 24.00000                                                  
12 df1 d        c 39.00000                                                  
13 df2 e        a 18.50000                                                  
14 df2 e        b 15.50000                                                  
15 df2 e        c 16.50000                                                  
16 df2 f        a 26.33333                                                  
17 df2 f        b 42.00000                                                  
18 df2 f        c 37.00000                                                  
19 df2 g        a 26.50000                                                  
20 df2 g        b 22.00000                                                  
21 df2 g        c 31.00000                                                  
22 df3 h        a 29.25000                                                  
23 df3 h        b 34.25000                                                  
24 df3 h        c 32.00000                                                  
25 df3 i        a 30.33333                                                  
26 df3 i        b 40.00000                                                  
27 df3 i        c 24.33333                                                  
28 df3 j        a 21.00000                                                  
29 df3 j        b  5.00000                                                  
30 df3 j        c 46.00000 

给出每个变量(a - c),每个因子d和每个子数据帧(df1-df3)的平均值。

答案 1 :(得分:3)

您始终只需lapply ddply

 lapply(list.1, function(x)   ddply(x, .(d), function(x)  
                             data.frame(a=mean(x$a),b=mean(x$b),c= mean(x$c))) )

或完全使用您的代码:

lapply(list.1, function(x) ddply(x,.(d),summarise, mean=mean(a)) )

答案 2 :(得分:1)

这是一个结合llply()ddply()的解决方案。首先,llply()将函数应用于列表的每个元素,并返回一个列表。然后ddply()应用于列表的每个数据帧,并根据列d划分每个数据帧。函数colMeans()用于计算每个数字列的平均值。

llply(list.1,function(x) ddply(x,.(d),function(x) colMeans(x[,1:3])))
$df1
  d        a     b        c
1 a 22.25000 26.25 34.25000
2 b 19.66667 22.00 28.66667
3 c 37.00000 44.50 18.00000
4 d 17.00000  3.00  4.00000

$df2
  d        a        b    c
1 e 20.50000 32.25000 18.5
2 f 25.33333 34.33333 21.0
3 g 20.50000 26.50000 16.5

$df3
  d    a        b        c
1 h 17.5 26.50000 37.25000
2 i 45.0 22.33333 26.33333
3 j 25.0 33.00000 42.00000