Question

我有一个包含顺序数据的数据框：
df <- data.frame( t1=c("e","e","e"),t2=c("e","e","u"),t3=c("e","e","u"),t4=c("e","u","e"),t5=c("e","u","e"))

看起来像

> df
  t1 t2 t3 t4 t5
1  e  e  e  e  e
2  e  e  e  u  u
3  e  u  u  e  e

我想将具有状态序列的数据帧转换为具有转换序列的数据帧，如下所示：

> dfNew
   t1  t2  t3  t4  t5
1  se  ee  ee  ee  ee
2  se  ee  ee  eu  uu
3  se  eu  uu  ue  ee

其中“s”表示起始状态。

感谢您的帮助。

Answer 1

这是一种创建过渡数据框的方法：

setNames(as.data.frame(t(apply(df, 1, 
                               function(x) 
                                 paste(c("s", head(x, -1)), x, sep = "")))),
                                                                       names(df))

  t1 t2 t3 t4 t5
1 se ee ee ee ee
2 se ee ee eu uu
3 se eu uu ue ee

Answer 2

使用TraMineR::seqetm

中的示例数据

data(actcal)
actcal.seq <- seqdef(actcal,13:24,
        labels=c("FullTime", "PartTime", "LowPartTime", "NoWork"))

您的示例似乎是使用print.stslist创建序列的seqconc的输出

所以我将创建这个序列manaully

actcal.seqconc <- seqconc(actcal.seq)

这是一个矩阵。因此，我们可以将此函数应用于-上的拆分，然后根据需要重新组合转换状态。执行此操作的功能如下：

transitions <- function(x, start = 'S') {

 x <- unlist(strsplit(x, '-')
 paste0(c(start, head(x, -1)), x, collapse = '-')
}

actcal.tseq <- as.matrix(apply( actcal.seqconc, 1, transitions))

如果您希望州之间的转换率使用seqtrate

seqtrate(actcal.seq)
 [>] computing transition rates for states A/B/C/D ...
            [-> A]      [-> B]      [-> C]      [-> D]
[A ->] 0.986991870 0.005203252 0.001084011 0.006720867
[B ->] 0.009700665 0.970343681 0.007760532 0.012195122
[C ->] 0.005555556 0.014814815 0.934259259 0.045370370
[D ->] 0.008705580 0.006279435 0.014985015 0.970029970

从基于状态的序列创建基于转换的序列

2 个答案: