如何将na.rm作为参数传递给tapply?

时间:2013-01-05 14:10:12

标签: r tapply na.rm

我想从一个数据框计算mean和sd,参数为一列,组标识为一列。使用tapply时如何计算它们?我可以使用sd(v1, group, na.rm=TRUE),但在使用na.rm=TRUE时不能使tapply符合语句。 omit.na是不可取的。我有一大堆参数,在排除所有缺少值的行时,必须逐步完成它们而不会丢失一半的数据帧。

data("weightgain", package = "HSAUR")
tapply(weightgain$weightgain, list(weightgain$source, weightgain$type), mean)

by语句也是如此。

x<-c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,NA)
y<-c(2,3,NA,3,4,NA,2,3,NA,2)
group<-rep((factor(LETTERS[1:2])),5)
df<-data.frame(x,y,group)
df

by(df$x,df$group,summary)
by(df$x,df$group,mean)

sd(df$x) #result: NA
sd(df$x, na.rm=TRUE) #result: 2.738613

有任何想法如何完成这项工作?

2 个答案:

答案 0 :(得分:20)

只需在na.rm=TRUE功能中设置tapply

tapply(weightgain$weightgain, list(weightgain$source, weightgain$type), mean, na.rm=TRUE)

答案 1 :(得分:5)

我认为这应该做你想要的。

  1. 选择所需的列:

    v = c("x", "y")#or
    v = colnames(df)[1:2]
    
  2. 使用sapply迭代v并将值传递给tapply

    sapply(v, function(i) tapply(df[[i]], df$group, sd, na.rm=TRUE))