Brew更新失败：未跟踪的工作树文件将被合并覆盖

时间：2013-01-01 19:19:03

标签： homebrew

尝试使用brew update更新Homebrew我收到以下错误

error: The following untracked working tree files would be overwrittenby merge:     
 Library/Formula/argp-standalone.rb
 Library/Formula/cocot.rb 
Please move or remove them before you can merge. 
Aborting 
Updating e088818..5909e2c 
Error: Failed while executing git pull  origin refs/heads/master:refs/remotes/origin/master

我在安装了Mountain Lion之后遇到类似问题的人发现了一篇博客文章（我本周也做过）。他解释了他如何删除错误消息中提到的文件

I removed these files:
$ cd $(brew --prefix)
$ rm cocot.rb
However, removing these files didn't help with the brew update. Instead I had to manually update brew through git:
$ cd $(brew --prefix)
$ git fetch origin
$ git reset --hard origin/master
$ brew update
Already up-to-date.

假设这些说明是正确的（我可能不应该假设），我试着按照这些说明进行操作

    $ cd $(brew --prefix)
    $ rm cocot.rb

然而，当我尝试使用rm cocot.rb

时，它说“文件不存在”

我不确定的一件事是cd $(brew --prefix)那些我输入的确切字词还是我必须用某些东西替换前缀？ CD是成功的，所以我假设它是正确的 - 它将我移动到/ usr / local，但没有文件要删除。 / usr / local的内容是

Cellar              clamXav             git             mysql               var Library             doc             heroku              mysql-5.5.15-osx10.6-x86_64 README.md           etc             include             rvm bin             foreman             lib             share

无论如何，你知道如何修复'brew update'

更新：根据favoretti的说明删除文件并尝试chown -R <your_username> $(brew --prefix)/.git后，运行brew update时出现以下错误

error: The following untracked working tree files would be overwritten by merge:
    Library/Aliases/gperftools
    Library/Aliases/hashdeep
    Library/Aliases/htop
    Library/Aliases/nodejs
    Library/Aliases/ocio
    Library/Aliases/oiio
    Library/Aliases/pgrep
    Library/Aliases/pkill
    Library/Aliases/qt4
    Library/Aliases/twolame
    Library/Aliases/wxwidgets
    Library/Contributions/cmds/brew-aspell-dictionaries
    Library/Contributions/cmds/brew-beer.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-dirty.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-graph
    Library/Contributions/cmds/brew-grep
    Library/Contributions/cmds/brew-leaves.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-linkapps.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-ls-taps.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-man
    Library/Contributions/cmds/brew-md5-to-sha1
    Library/Contributions/cmds/brew-mirror-check.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-pull.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-readall.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-server
    Library/Contributions/cmds/brew-services.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-switch.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-test-bot.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-tests.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-unpack.rb
    Library/Contributions/cmds/brew-which.rb
    Library/Contributions/cmds/git
    Library/Contributions/cmds/svn
    Library/ENV/4.3/apr-1-config
    Library/ENV/4.3/bsdmake
    Library/ENV/4.3/c++
    Library/ENV/4.3/c89
    Library/ENV/4.3/c99
    Library/ENV/4.3/cc
    Library/ENV/4.3/clang
    Library/ENV/4.3/clang++
    Library/ENV/4.3/cpp
    Library/ENV/4.3/g++
    Library/ENV/4.3/gcc
    Library/ENV/4.3/git
    Library/ENV/4.3/i686-apple-darwin11-llvm-g++-4.2
    Library/ENV/4.3/i686-apple-darwin11-llvm-gcc-4.2
    Library/ENV/4.3/ld
    Library/ENV/4.3/llvm-g++
    Library/ENV/4.3/llvm-g++-4.2
    Library/ENV/4.3/llvm-gcc
    Library/ENV/4.3/llvm-gcc-4.2
    Library/ENV/4.3/make
    Library/ENV/4.3/mig
    Library/ENV/4.3/sed
    Library/ENV/4.3/svn
    Library/ENV/4.3/xcrun
    Library/ENV/libsuperenv.rb
    Library/ENV/pkgconfig/leopard/libcrypto.pc
    Library/ENV/pkgconfig/leopard/libcurl.pc
    Library/ENV/pkgconfig/mountain_lion/libcurl.pc
    Library/ENV/pkgconfig/mountain_lion/libexslt.pc
    Library/ENV/pkgconfig/mountain_lion/libxml-2.0.pc
    Library/ENV/pkgconfig/mountain_lion/libxslt.pc
    Library/Formula/abcl.rb
    Library/Formula/abcmidi.rb
    Library/Formula/aiccu.rb
    Library/Formula/akka.rb
    Library/Formula/alac.rb
    Library/Formula/alure.rb
    Library/Formula/appledoc.rb
    Library/Formula/arangodb.rb
    Library/Formula/argp-standalone.rb
    Library/Formula/argtable.rb
    Library/Formula/autopano-sift-c.rb
    Library/Formula/avian.rb
    Library/Formula/avidemux.rb
    Library/Formula/avro-cpp.rb
    Library/Formula/aws-cloudsearch.rb
    Library/Formula/aws-sns-cli.rb
    Library/Formula/backupninja.rb
    Library/Formula/bact.rb
    Library/Formula/bam.rb
    Library/Formula/basex.rb
    Library/Formula/berkeley-db4.rb
    Library/Formula/bind.rb
    Library/Formula/blazeblogger.rb
    Library/Formula/bochs.rb
    Library/Formula/boost149.rb
    Library/Formula/bsdconv.rb
    Library/Formula/bsdmake.rb
    Library/Formula/buildapp.rb
    Library/Formula/bup.rb
    Library/Formula/byacc.rb
    Library/Formula/cadubi.rb
    Library/Formula/camellia.rb
    Library/Formula/casperjs.rb
    Library/Formula/ccextractor.rb
    Library/Formula/cconv.rb
    Library/Formula/cdo.rb
    Library/Formula/cdpr.rb
    Library/Formula/cgvg.rb
    Library/Formula/checkstyle.rb
    Library/Formula/chordii.rb
    Library/Formula/chruby.rb
    Library/Formula/cifer.rb
    Library/Formula/clhep.rb
    Library/Formula/cntlm.rb
    Library/Formula/cocot.rb
    Library/Formula/cogl.rb
    Library/Formula/collada-dom.rb
    Library/Formula/crash.rb
    Library/Formula/crossroads.rb
    Library/Formula/crosstool-ng.rb
    Library/Formula/css-crush.rb
    Library/Formula/csync.rb
    Library/Formula/ctemplate.rb
    Library/Formula/curlftpfs.rb
    Library/Formula/cutter.rb
    Library/Formula/cvsutils.rb
    Library/Formula/darkstat.rb
    Library/Formula/darner.rb
    Library/Formula/dart.rb
    Library/Formula/dasm.rb
    Library/Formula/debianutils.rb
    Library/Formula/dfc.rb
    Library/Formula/dgtal.rb
    Library/Formula/dhcping.rb
    Library/Formula/di.rb
    Library/Formula/dmtx-utils.rb
    Library/Formula/drip.rb
    Library/Formula/dsniff.rb
    Library/Fo
Aborting
Updating e088818..c1fbc29
Error: Failed while executing git pull  origin refs/heads/master:refs/remotes/origin/master

12 个答案:

答案 0 :(得分：361)

您需要执行以下操作：

cd $(brew --prefix)
rm Library/Formula/argp-standalone.rb
rm Library/Formula/cocot.rb

然后执行

git fetch origin
git reset --hard origin/master
brew update

基本上，要解释一下：

cd $(brew --prefix)

告诉cd将目录更改为brew --prefix将输出的内容。 如果您尝试执行brew --prefix命令，您应该看到以下行中的内容：

brew --prefix
/usr/local

因此，在这种情况下，命令将等同于cd /usr/local。 较新的brew版本在其安装前缀和Library/Formula/下有公式，因此您需要查找那些过时/更改过的文件。

请注意，如果您因特定原因（例如固定版本）而自行更改了这些公式，则此操作会将其还原为默认值，并可能产生不良影响。

@TedPennings在评论中指出这对他有用，但他的序列是：

  1. 将所有内容chown到my_username:admin，即sudo chown -R ted:admin $(brew --prefix)
  2. 运行上面的两个git命令，git fetch origin和git reset --hard origin/master

答案 1 :(得分：279)

cd $(brew --prefix)
git reset --hard HEAD
brew update

答案 2 :(得分：46)

这是由update代码中的旧错误造成的，该错误早已得到修复。但是，错误的性质要求您执行以下操作：

cd $(brew --repository)
git reset --hard FETCH_HEAD

如果brew doctor仍抱怨未提交的修改，也请运行以下命令：

cd $(brew --repository)    
git clean -fd

答案 3 :(得分：31)

$ cd $(brew --prefix)
$ git clean -fd
$ git reset --hard
$ sudo chown -R `whoami` `brew --prefix`
$ brew update

注意：第2步和第3步对我有用，因为我在收到错误之前在4之前执行了第5步。更改文件夹所有者之前的 brew更新会导致整个问题。

答案 4 :(得分：6)

我有一个类似的问题，我的brew包库以root用户身份下载，然后我无法运行brew更新，因为git会抱怨无法合并文件。

解决方案是： - 

sudo chown -R <user> /usr/local/Library

答案 5 :(得分：5)

如果您不介意放弃对可能已应用的公式的潜在修改，则重置brew存储库应该是最有效的方法：

$ cd `brew --prefix`
$ git fetch origin
$ git reset --hard origin/master
$ brew cleanup --force
$ brew update

答案 6 :(得分：4)

通过在这些路径中添加admin group write（和setgid bit）权限，我能够在我的计算机上修复此问题：

sudo chmod -R g+ws /usr/local /Library/Caches/Homebrew

s在执行时设置组ID，以便下次其他管理员用户更新或升级Homebrew时不会丢失写入权限。

这个答案有点不完整，因为当我尝试执行brew cleanup --force时，Homebrew尝试删除/ usr / local / Cellar /中的内容时会出现权限问题。 （不幸的是，我目前无法对此进一步调查。）

答案 7 :(得分：1)

另一种选择是使用git stash。

brew update命令执行git pull，因此如果有任何更改的文件（甚至文件属性，当我在递归中更改目录中的权限时发生这种情况），您必须以某种方式修复冲突。使用git stash是一种方式;它需要进行任何更改并将它们放在一边，以便您有效地恢复到上次更新的repo版本。 Homebrew'location'默认为/usr/local，它安装为git存储库。您可以查找.git文件夹以便自己查看。我正在编写一个自制卸载脚本，以便在我的GitHub配置文件中发布更多信息。

答案 8 :(得分：1)

sudo chown -R USER /usr/local/bin

注意 - 对于USER使用命令，即您的用户名

sudo brew doctor

答案 9 :(得分：1)

这种方法可能比某些方法简单。它涉及：

  • 修复git问题，以便您可以再次委托对其进行更改管理。
  • 没有手动移动文件或目录。
  • 无需手动调整文件或目录权限。

步骤（有需要解释的人的注释）：

cd $(brew --repository)                              // see Note 1 below
git remote add brew https://github.com/Homebrew/brew // see Note 2 below
git pull brew master                                 // promising fast-forward report!
brew update                                          // see Note 3 below

概述：
据我所知，这个问题的实际原因是回购网址的变化。它现在是brew并且是brew.git。 （完整的最新网址：https://github.com/Homebrew/brew）

注1：第一个命令将您从文件结构中的任何位置带到正确的目录。对我来说，目录结构与上面显示的不同（Mac OS 10.11.16），但是使用此命令，这些差异无关紧要。

注2：第二个命令将正确的远程URL添加到新别名中;我这样做是为了防止这种方法没有达到我想要的效果，我再次需要以前的地址。由于新的遥控器工作，我邀请其他人评论只是通过原点更改别名的URL。我很乐意更新答案，以反映对您有用的内容。

注3：此第四个命令具有完全所需的结果：它报告大量更新，包括＆＃34; ==＆gt;的特别好的报告。将HOMEBREW_REPOSITORY迁移到/ usr / local / Homebrew！＆＃34; （强调他们的）。

答案 10 :(得分：0)

更新到El Capitan后，

This post帮助了我。在我的情况下，var number = 2; var numberInString = number.toString(); var code = numberInString.charCodeAt(0); console.log(code); 没有工作（＆＃34; zsh：命令未找到：chown＆＃34;），所以第1步是将此行添加到我的.zshrc中：

chown

我已经尝试过上面几个比较流行的答案了，所以我非常确定当我从博客帖子粘贴到关键命令时，export PATH="$PATH:/usr/sbin"会变得干净：

git status

答案 11 :(得分：0)

这应该有用。

1. cd `brew --prefix`
2. git fetch origin
3. git reset --hard origin/master
4. sudo brew update
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