Numpy genfromtxt - 列名

时间:2012-11-23 02:39:16

标签: python numpy

我正在尝试使用genfromtxt导入一个简单的制表符分隔文本文件。我需要访问每个列标题名称,以及与该名称关联的列中的数据。目前我正以一种看起来有点奇怪的方式实现这一目标。 txt文件中的所有值(包括标题)都是十进制数。

sample input file:

1     2     3     4      # header row
1.2   5.3   2.8   9.5
3.1   4.5   1.1   6.7
1.2   5.3   2.8   9.5
3.1   4.5   1.1   6.7
1.2   5.3   2.8   9.5
3.1   4.5   1.1   6.7


table_data = np.genfromtxt(file_path)       #import file as numpy array
header_values = table_data[0,:]             # grab first row
table_values = np.delete(table_data,0,0)    # grab everything else

我知道必须有更合适的方法来导入数据的文本文件。我需要轻松访问每个列的标题以及与该标题值相关的相应数据。感谢您提供的任何帮助。

澄清:

我希望能够通过使用table_values [header_of_first_column]行中的内容来访问数据列。我该如何做到这一点?

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

使用names parameter将第一个有效行用作列名:

data = np.genfromtxt(
    fname,
    names = True, #  If `names` is True, the field names are read from the first valid line
    comments = '#', # Skip characters after #
    delimiter = '\t', # tab separated values
    dtype = None)  # guess the dtype of each column

例如,如果我将您发布的数据修改为真正以制表符分隔,则以下代码可以正常工作:

import numpy as np
import os
fname = os.path.expanduser('~/test/data')
data = np.genfromtxt(
    fname,
    names = True, #  If `names` is True, the field names are read from the first valid line
    comments = '#', # Skip characters after #
    delimiter = '\t', # tab separated values
    dtype = None)  # guess the dtype of each column
print(data)
# [(1.2, 5.3, 2.8, 9.5) (3.1, 4.5, 1.1, 6.7) (1.2, 5.3, 2.8, 9.5)
#  (3.1, 4.5, 1.1, 6.7) (1.2, 5.3, 2.8, 9.5) (3.1, 4.5, 1.1, 6.7)]

print(data['1'])
# [ 1.2  3.1  1.2  3.1  1.2  3.1]