Question

我正在研究一个使用gplots Library的R脚本。因此在剧本的某些方面

library(gplots)

被调用。使用32位Linux机箱（Linux和3.2.0-33-generic-pae 52-Ubuntu SMP i686 GNU / Linux，Ubuntu 12.04）可以很好地工作。但是，我尝试在64位计算机上运行脚本（Linux sim 2.6.38-15-server 66-Ubuntu SMP x86_64 GNU / Linux; Ubuntu 11.04），现在它抛出错误：

Error in library(gplots) : there is no package called 'gplots'
Calls: generateHeatmap -> library
Execution halted

所以当我尝试安装gplots时会引发另一个错误：

> install.packages('gplots', type="source", dependencies=T)
ERROR: dependency ‘gdata’ is not available for package ‘gplots’
* removing ‘/home/schaller/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/gplots’
...

因此，我正在尝试安装gdata：

>install.packages('gdata', type="source", dependencies=F)
Installing package(s) into ‘/home/schaller/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning message:
In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) :
  package ‘gdata’ is not available

我在网上搜索了可能的解决方案。我找不到任何东西。但是，我读到在64位模式下当前R版本的gdata被破坏了。有人发布了补丁回购[1]，但我无法使用这个回购安装gdata。那么这意味着现在不可能在64位机器上使用这个软件包吗？

[1] - https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2010-April/236966.html

更多信息：R版本2.12.1

解答：将r-base更新为当前版本解决了问题。

Answer 1

你应该能够做到

$ sudo apt-get install r-cran-gplots

之后，从Ubuntu repo安装了gdata和gplots。

您当然也可以使用您喜欢的任何包管理前端。

安装gdata失败（在64位Linux上）

1 个答案: