Question

我正致力于将DNA序列转换为蛋白质序列我已经完成了所有程序只有一个错误，我发现它有结构 dna_codon是一个结构，我正在迭代它。在第一次迭代中，它显示了正确的结构值，但是从下一次迭代，它没有显示存储在结构中的正确值。

这是一个小错误，所以不要以为我做过任何事情并且投票。我被困在这里，因为我是c的新结构。

代码：

#include <stdio.h>  
#include<string.h>


void main()
{

int i, len;
char short_codons[20];
char short_slc[1000];
char sequence[1000];

struct codons
{
    char amino_acid[20], slc[20], dna_codon[40];
};

struct codons c1 [20]= {
                        {"Isoleucine", "I", "ATT, ATC, ATA"},
                        {"Leucine", "L", "CTT, CTC, CTA, CTG, TTA, TTG"},
                        {"Valine", "V", "GTT, GTC, GTA, GTG"},
                        {"Phenylalanine", "F", "TTT, TTC"},
                        {"Methionine", "M", "ATG"},
                        {"Cysteine", "C", "TGT, TGC"},
                        {"Alanine", "A", "GCT, GCC, GCA, GCG"},
                        {"Proline", "P", "CCT, CCC, CCA,CCG "},
                        {"Threonine", "T", "ACT, ACC, ACA, ACG"},
                        {"Serine", "S", "TCT, TCC, TCA, TCG, AGT, AGC"},
                        {"Tyrosine", "Y", "TAT, TAC"},
                         {"Tryptophan", "W", "TGG"},
                        {"Glutamine", "Q", "CAA, CAG"},
                        {"Aspargine","N" "AAT, AAC"},
                        {"Histidine", "H", "CAT, CAC"},
                        {"Glutamic acid", "E", "GAA, GAG"},
                        {"Aspartic acid", "D", "GAT, GAC"},
                        {"Lysine", "K", "AAA, AAG"},
                        {"Arginine", "R", "CGT, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG"},
                        {"Stop codons", "Stop", "AA, TAG, TGA"}
                        };


int count = 0;

printf("Enter the sequence: ");
gets(sequence);

char *input_string = sequence;
char *tmp_str = input_string;

int k;
char *pch;

while (*input_string != '\0')
{
    char string_3l[4] = {'\0'};
    strncpy(string_3l, input_string, 3);
    printf("\n-----------%s & %s----------", string_3l, tmp_str );
    for(k=0;k<20;k++)
    {
        //printf("@REAL -  %s", c1[0].dna_codon);
        printf("@ %s", c1[k].dna_codon);
        int x;
        x = c1[k].dna_codon;
        pch = strtok(x, ",");
        while (pch != NULL)
        {
            printf("\n%d : %s with %s", k, string_3l, pch);
            count=strcmp(string_3l, pch);
            if(count==0)
            {
                strcat(short_slc, c1[k].slc);
                printf("\n==>%s", short_slc);
            }
        pch = strtok (NULL, " ,.-");
        }
    }
input_string = input_string+3;
}

printf("\nProtien sequence is : %s\n", short_slc);
}

INPUT：

TAGTAG

输出：
如果你看到

的输出

printf("\n-----------%s & %s----------", string_3l, tmp_str );

在两次迭代中，我们发现结构中定义的值减少了。

我想知道为什么结构减少它或我的错误？因为我被困在这里

需要输出：

StopStop

Answer 1

strtok()必须仅用于字符串的重复副本，因为它会用'\ 0'覆盖“分隔符”以在必要时生成标记。

下面的代码会砍掉字符串：

x = c1[k].dna_codon;
pch = strtok(x, ",");

e.g：

String = "CTT, CTC, CTA, CTG, TTA, TTG"

首先strtok()调用'\ 0'后覆盖''，'

String = "CTT"\0" CTC, CTA, CTG, TTA, TTG"砍掉字符串。为了便于阅读，添加了'\ 0'。

当strtok()保持指向字符串其余部分的指针时，您对第一个循环是安全的。在第二个循环期间，字符串只会是：

String = "CTT"

PS：对于性能，如果可行，您可以使用字符串数组而不是dna_codon[40]或链接列表。每次比较的斩波/定位分隔符都是开销。

IEEE Std 1003.1-2008 strtok()

Answer 2

虽然我不知道你想要什么样的输出。但是如果直接运行你的代码，我就会出现段故障。

永远不要使用gets()。这是非常重要的。请改用fgets（）。你可以写fgets(sequence, 1000, stdin)。
strtok修改dna_codon时与x无关。没有什么可以阻止strtok从外面。
如果要拆分dna_codon而不想修改它，则应复制字符串。使用strcpy(char*,char*)。这将是一个真正的副本（两个字符串）。如果您只是将字符串分配给另一个变量。它们只是指向相同字符串的两个指针。

char x [40]; 的strcpy（X，C 1 [k]的.dna_codon）; //而不是x = dna_codon

将DNA转化为蛋白质 - c结构问题

2 个答案: