Question

我在Windows上使用wampserver创建一个页面并在本地工作。我想访问数据库Ensemble以获取一些有用的信息，例如基因序列，我遇到了以下问题：

我已经安装了ActivePerl和API，并且我的bioperl脚本在命令提示符下运行完美。

就像wampserver一样，我修改了Apache中的httpd.conf来运行perl脚本。一个简单的perl脚本（例如hello world）我可以通过wamp执行。（我在www上存储了id并转到localhost / hello.pl）

当我想在wampserver中运行脚本以获取序列时（当然更复杂）我收到此错误：

install_driver（mysql）失败：找不到@INC中的DBD / mysql.pm（@INC包含：C：/ wamp / bin / Perl / lib C：/ wamp / bin / Perl / site / lib.C ：/ src / ensembl / modules）在（eval 8）第3行。也许DBD :: mysql perl模块还没有完全安装，或者'mysql'的大写是不对的。可用的驱动程序：DBM，ExampleP，文件，Gofer，代理，海绵。在C：/src/ensembl/modules/Bio/EnsEMBL/Registry.pm第1594行

在命令提示符窗口中，脚本运行。我如何管理它在wampserver中运行它？

感谢您的提前帮助

Answer 1

@INC数组包含Perl查找模块的所有路径。目前，您的WAMP Perl会查看这些地方：

C:/wamp/bin/Perl/lib
C:/wamp/bin/Perl/site/lib
.
C:/src/ensembl/modules

这些目录中没有一个包含子目录DBD，而子目录mysql.pm又包含@INC。（请与文件管理员核实）

您似乎已将此模块与ActivePerl一起安装。尝试打印出perl的@INC。如果ActivePerl @INC包含未包含在WAMP perl use lib 'C:/foo/bar/lib';中的路径（参见上文），那么您应该修复它以使用您的ActivePerl模块。 E.g。

use DBD::mysql

之前你{{1}}。它可能会解决问题。

在Wampserver中运行BioPerl脚本

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