R - geom_density()使用什么算法以及如何提取曲线的点/方程?

时间:2012-09-12 18:36:08

标签: r ggplot2

我想知道geom_density()究竟在做什么,所以我证明了图形的合理性,以及是否有任何方法可以提取为每条绘制的曲线生成的函数或点。

由于

2 个答案:

答案 0 :(得分:19)

键入get("compute_group", ggplot2::StatDensity)(或以前,get("calculate", ggplot2:::StatDensity))将为您提供用于计算密度的算法。 (从根本上说,这是对density()的调用,默认为kernel="gaussian"。)

情节中使用的点由print.ggplot()无形返回,因此您可以像这样访问它们:

library(ggplot2)
m <- ggplot(movies, aes(x = rating))
m <- m + geom_density()
p <- print(m)
head(p$data[[1]], 3)
#           y      x   density   scaled  count PANEL group ymin      ymax
# 1 0.0073761 1.0000 0.0073761 0.025917 433.63     1     1    0 0.0073761
# 2 0.0076527 1.0176 0.0076527 0.026888 449.88     1     1    0 0.0076527
# 3 0.0078726 1.0352 0.0078726 0.027661 462.81     1     1    0 0.0078726


## Just to show that those are the points you are after, 
## extract and use them to create a lattice xyplot 
library(gridExtra)
library(lattice)
mm <- xyplot(y ~x, data=p$data[[1]], type="l")

enter image description here

答案 1 :(得分:4)

正如其他答案中所建议的那样,您可以使用print.ggplot()访问ggplot点。但是,print() - 代码也会打印ggplot对象,这可能是不可取的。

您可以使用ggplot_build()提取ggplot对象数据而无需打印图

library(ggplot2)
library(ggplot2movies)

m <- ggplot(movies, aes(x = rating))
m <- m + geom_density()
p <- ggplot_build(m)  # <---- INSTEAD OF `p <- print(m)`
head(p$data[[1]], 3)
#             y        x     density     scaled    count     n PANEL group ymin
# 1 0.007376115 1.000000 0.007376115 0.02591684 433.6271 58788     1    -1    0
# 2 0.007652653 1.017613 0.007652653 0.02688849 449.8842 58788     1    -1    0
# 3 0.007872571 1.035225 0.007872571 0.02766120 462.8127 58788     1    -1    0


# Just to show that those are the points you are after, extract and use them 
# to create a lattice xyplot 
library(lattice)
m2 <- xyplot(y ~x, data=p$data[[1]], type="l")

library(gridExtra)
grid.arrange(m, m2, nrow=1)

enter image description here