使用JTransforms库计算与FFT的自相关

时间:2012-09-02 19:33:37

标签: java fft time-series correlation

我正在尝试使用下面的代码计算时间序列中的示例窗口的自相关。我正在对该窗口应用FFT,然后计算实部和虚部的大小并将虚部设置为零,最后对其进行逆变换以获得自相关:

DoubleFFT_1D fft = new DoubleFFT_1D(magCnt);
fft.realForward(magFFT);

magFFT[0] = (magFFT[0] * magFFT[0]);
for (int i = 1; i < (magCnt - (magCnt%2)) / 2; i++) {
    magFFT[2*i] = magFFT[2*i] * magFFT[2*i] + magFFT[2*i + 1] * magFFT[2*i + 1];
    magFFT[2*i + 1] = 0.0;
}

if (magCnt % 2 == 0) {
    magFFT[1] = (magFFT[1] * magFFT[1]);
} else {
    magFFT[magCnt/2] = (magFFT[magCnt-1] * magFFT[magCnt-1] + magFFT[1] * magFFT[1]);
}

autocorr = new double[magCnt];
System.arraycopy(magFFT, 0, autocorr, 0, magCnt);
DoubleFFT_1D ifft = new DoubleFFT_1D(magCnt);
ifft.realInverse(autocorr, false);

for (int i = 1; i < autocorr.length; i++)
    autocorr[i] /= autocorr[0];
autocorr[0] = 1.0;

第一个问题是:可以看出,此代码将自相关结果映射到[0,1]范围,尽管相关性应该介于-1和1之间。当然,很容易将结果映射到{{1范围,但我不确定这种映射是否正确。我们如何解释生成的[-1,1]数组中的值?

其次,使用这段代码,我对某些周期序列产生了良好的结果,即根据信号周期得到特定自相关指数的更高值。然而,当我将它应用于非周期性信号时,结果很奇怪:autocorr数组中的所有值似乎都非常接近1.这是什么原因?

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

要使基于FFT的算法起作用,您必须特别注意定义,包括您正在使用的库的约定。您似乎混淆了AC的“信号处理”惯例和“统计”惯例。然后是FFT包装和零填充。

这是一个适用于偶数N情况信号处理惯例的代码。它是针对强力包裹的自相关进行测试的。评论显示了如何将其转换为信号处理惯例。对于统计ac,减去数据的平均值。这可以仅通过将FFT的“0Hz”分量归零来完成。然后ac的第零个元素是方差,你可以通过除以这个数量来标准化。如你所说,结果值将落在-1..1。

您的代码似乎正在进行分割,但不会忽略数据的0 Hz分量。所以它正在计算某种约定的mashup。

import edu.emory.mathcs.jtransforms.fft.DoubleFFT_1D;
import java.util.Arrays;

public class TestFFT {

    void print(String msg, double [] x) {
        System.out.println(msg);
        for (double d : x) System.out.println(d);
    }

    /**
     * This is a "wrapped" signal processing-style autocorrelation. 
     * For "true" autocorrelation, the data must be zero padded.  
     */
    public void bruteForceAutoCorrelation(double [] x, double [] ac) {
        Arrays.fill(ac, 0);
        int n = x.length;
        for (int j = 0; j < n; j++) {
            for (int i = 0; i < n; i++) {
                ac[j] += x[i] * x[(n + i - j) % n];
            }
        }
    }

    private double sqr(double x) {
        return x * x;
    }

    public void fftAutoCorrelation(double [] x, double [] ac) {
        int n = x.length;
        // Assumes n is even.
        DoubleFFT_1D fft = new DoubleFFT_1D(n);
        fft.realForward(x);
        ac[0] = sqr(x[0]);
        // ac[0] = 0;  // For statistical convention, zero out the mean 
        ac[1] = sqr(x[1]);
        for (int i = 2; i < n; i += 2) {
            ac[i] = sqr(x[i]) + sqr(x[i+1]);
            ac[i+1] = 0;
        }
        DoubleFFT_1D ifft = new DoubleFFT_1D(n); 
        ifft.realInverse(ac, true);
        // For statistical convention, normalize by dividing through with variance
        //for (int i = 1; i < n; i++)
        //    ac[i] /= ac[0];
        //ac[0] = 1;
    }

    void test() {
        double [] data = { 1, -81, 2, -15, 8, 2, -9, 0};
        double [] ac1 = new double [data.length];
        double [] ac2 = new double [data.length];
        bruteForceAutoCorrelation(data, ac1);
        fftAutoCorrelation(data, ac2);
        print("bf", ac1);
        print("fft", ac2);
        double err = 0;
        for (int i = 0; i < ac1.length; i++)
            err += sqr(ac1[i] - ac2[i]);
        System.out.println("err = " + err);
    }

    public static void main(String[] args) {
        new TestFFT().test();
    }
}