我正在尝试根据2个字符串之间的比较来指定相似度分数。在R中是否有相同的功能。我在SAS中通过SPEDIS的名称了解这样的功能。如果R中有这样的功能,请告诉我。
答案 0 :(得分:40)
函数adist计算两个字符串之间的Levenshtein edit distance。这可以转换为1 - (Levenshtein编辑距离/更长的字符串长度)的相似性度量。
RecordLinkage包中的levenshteinSim
函数也可以直接执行此操作,并且可能比adist
更快。
library(RecordLinkage)
> levenshteinSim("apple", "apple")
[1] 1
> levenshteinSim("apple", "aaple")
[1] 0.8
> levenshteinSim("apple", "appled")
[1] 0.8333333
> levenshteinSim("appl", "apple")
[1] 0.8
ETA:有趣的是,虽然RecordLinkage包中的levenshteinDist
似乎比adist
略快,但levenshteinSim
比其中任何一个慢得多。使用rbenchmark包:
> benchmark(levenshteinDist("applesauce", "aaplesauce"), replications=100000)
test replications elapsed relative
1 levenshteinDist("applesauce", "aaplesauce") 100000 4.012 1
user.self sys.self user.child sys.child
1 3.583 0.452 0 0
> benchmark(adist("applesauce", "aaplesauce"), replications=100000)
test replications elapsed relative user.self
1 adist("applesauce", "aaplesauce") 100000 4.277 1 3.707
sys.self user.child sys.child
1 0.461 0 0
> benchmark(levenshteinSim("applesauce", "aaplesauce"), replications=100000)
test replications elapsed relative
1 levenshteinSim("applesauce", "aaplesauce") 100000 7.206 1
user.self sys.self user.child sys.child
1 6.49 0.743 0 0
这个开销仅仅归因于levenshteinSim
的代码,它只是levenshteinDist
的包装:
> levenshteinSim
function (str1, str2)
{
return(1 - (levenshteinDist(str1, str2)/pmax(nchar(str1),
nchar(str2))))
}
仅供参考:如果你总是比较两个字符串而不是矢量,你可以创建一个使用max
代替pmax
的新版本,并减少约25%的运行时间:
mylevsim = function (str1, str2)
{
return(1 - (levenshteinDist(str1, str2)/max(nchar(str1),
nchar(str2))))
}
> benchmark(mylevsim("applesauce", "aaplesauce"), replications=100000)
test replications elapsed relative user.self
1 mylevsim("applesauce", "aaplesauce") 100000 5.608 1 4.987
sys.self user.child sys.child
1 0.627 0 0
长话短说 - adist
和levenshteinDist
在性能方面差别不大,但如果您不想添加包依赖项,前者更可取。如何将其转化为相似性度量确实会对性能产生一些影响。