在mac OS Lion上预装了python 2.6.7的numpy和scipy

时间:2012-07-11 23:21:55

标签: python numpy osx-lion scipy

有没有在Mac OS Lion附带的python 2.6.7上安装numpy和scipy?我知道Lion也有Python 2.7。但我需要坚持使用Python 2.6,因为我使用的模块在Python 2.7上不起作用。

3 个答案:

答案 0 :(得分:34)

Lion为每个Python实现提供了easy_install/usr/bin/easy_install-2.7用于/usr/bin/python2.7,同样用于2.6和2.5。

但是,scipy需要一个Fortran编译器,并且Lion不附带其中一个。看起来你必须在安装numpy之前安装Fortran编译器,否则scipy将无法在以后安装。

首先,您需要Xcode命令行工具。 (Apple经常更改此软件包的名称 - 可能是“Unix开发工具”,或“CLI开发工具链”等,具体取决于您的Xcode版本。)

这些可以由Xcode本身安装。如果您使用的是4.3.x,则从App Store安装Xcode后,启动它,转到“首选项”,“下载”,“组件”,然后单击“命令行工具”旁边的“安装”按钮。对于不同的版本,或者如果您想在没有Xcode的情况下安装它们,Homebrew页面(见下文)将介绍如何获取它们,或者您可以浏览Apple's developer site

如果您已经拥有包管理器(Homebrew,MacPorts或Fink),请使用它。如果不这样做,请安装Homebrew

curl https://raw.github.com/gist/323731/25f99360c7de3f72027d8fd07cb369b1c8756ea6/install_homebrew.rb -o /tmp/install_homebrew.rb
ruby /tmp/install_homebrew.rb
rehash

然后像这样安装gfortran:

brew install gfortran

现在你已经准备好安装numpy和scipy了。如果你更喜欢pip到easy_install(如果你不知道,你可能更喜欢pip),你必须先安装它:

sudo easy_install-2.6 pip

然后用它来安装软件包:

sudo pip-2.6 install numpy

根据您的确切操作系统版本和其他详细信息,您可能已经拥有2.6的内置numpy,但该numpy没有Fortran支持。您可以告诉我们,因为sudo pip-2.6 install numpyRequirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): numpy in /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python。解决方案是完全按照错误消息说的那样:

sudo pip-2.6 install --upgrade numpy

最后:

sudo pip-2.6 install scipy

答案 1 :(得分:24)

我遇到了在Mountain Lion上安装SciPy的类似问题。

OSX Mountain Lion 10.8

Python 2.7.3

pip 1.1

brew 0.9.2

GNU Fortran(GCC)4.2.1

我收到的一些错误包括:

此:

pip install scipy

产生了这个错误:

Could not locate executable pgfortran

don't know how to compile Fortran code on platform 'posix'

building 'dfftpack' library

error: library dfftpack has Fortran sources but no Fortran compiler found

这促使我寻找Fortran编译器:

此命令:

brew install gfortran

出现了这个错误:

Error: Currently the gfortran compiler provided by this brew is only supports the following versions of XCode:

    - XCode 3.1.4 on OS X 10.5.x
    - XCode 3.2.2/3.2.3 -- 4.0 on OS X 10.6.x
    - XCode 4.1 or newer on OS X 10.7.x

The AppStore and Software Update can help upgrade your copy of XCode.
The latest version of XCode is also available from:

http://developer.apple.com/technologies/xcode.html

导致我发表了一篇博文:http://www.joewandy.com/。我遵循了这个建议:

此命令:

brew edit gfortran

将使用xcode打开文件。我在两个地方修改了这个文件:

论文2行:

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION == 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666)"

更改为:

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION >= 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher"
换句话说,

== 10.7更改为>= 10.7 和 已将XCode 4.2 (build 5666)更改为XCode 4.2 (build 5666) or higher

然后我做了

brew install gfortran

一次。这是成功的消息:

Downloading http://r.research.att.com/tools/gcc-42-5666.3-darwin11.pkg

Already downloaded: /Library/Caches/Homebrew/gfortran-4.2.4-5666.3.pkg
==> Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher
==> Caveats
Brews that require a Fortran compiler should not use:

depends_on 'gfortran'

The preferred method of declaring Fortran support is to use:

def install
    ...
    ENV.fortran
    ...
end

==> Summary

/usr/local/Cellar/gfortran/4.2.4-5666.3: 86 files, 72M, built in 2 seconds

然后我做了:

pip install scipy

但这给了我这个:

#error "<vecLib/vecLib.h> is deprecated.  Please #include <Accelerate/Accelerate.h> and link to Accelerate.framework."

然后我发现这篇博文: 在山狮上编译SciPy http://www.thisisthegreenroom.com/2012/compiling-scipy-on-mountain-lion/

表示使用此命令:

pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

这需要大约5至6分钟才能完成

Installed /Users/hernamesbarbara/src/scipy
Successfully installed scipy
Cleaning up...

之后我可以做

python


Python 2.7.3 (v2.7.3:70274d53c1dd, Apr  9 2012, 20:52:43) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import scipy
>>> help(scipy)

    Help on package scipy:

NAME
    scipy

成功!

安装了SciPy版本:

full_version = '0.12.0.dev-14b1e07'
git_revision = '14b1e07602ff33a6e8250eb2bc7a6816677606a9'
release = False
short_version = '0.12.0'
version = '0.12.0.dev-14b1e07'

答案 2 :(得分:2)

我认为你不需要安装Brew和XCode,也不需要自己编译gfortran:我从http://hpc.sourceforge.net安装了gfortran的编译版本,一切似乎都在工作。 (我在10.7.5)