在open-mpi / mpi-run中加载共享库

Question

我正在尝试使用mpi run使用扭矩调度程序来运行我的程序。虽然在我的pbs文件中我按

加载了所有库

export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/library

但是它给出了错误，即

error while loading shared libraries: libarmadillo.so.3: 
cannot open shared object file: No such file or directory. 

我猜错误在于所有节点中都没有设置变量LD_LIBRARY_PATH。我怎么能让它发挥作用？

Answer 1

LD_LIBRARY_PATH不会自动导出到由mpirun生成的MPI流程。你应该使用

mpirun -x LD_LIBRARY_PATH ...

推送LD_LIBRARY_PATH的值。还要确保指定的路径存在于群集中的所有节点上，libarmadillo.so.3随处可用。

Answer 2

在某些系统上，您的环境并不总是通过mpirun传播。您应该在.bashrc文件中设置所有这些变量。