R:环境的缓存/备忘录

时间:2012-07-06 07:21:33

标签: r oop caching memoization proto

我想使用memoization来缓存某些昂贵操作的结果,这样就不会一遍又一遍地计算它们。

memoiseR.cache都符合我的需求。但是,我发现调用之间的缓存效果不佳。

以下示例演示了我所看到的问题:

library(memoise)

# Memoisation works: b() is called only once
a <- function(x) runif(1)
replicate(5, a())
b <- memoise(a)
replicate(5, b())

# Memoisation fails: mfn() is called every single time
ProtoTester <- proto(
  calc = function(.) {
    fn <- function() print(runif(1))
    mfn <- memoise(fn)
    invisible(mfn())
  }      
)
replicate(5, ProtoTester$calc())

根据回答更新

根据是使用持久缓存还是非持久缓存,此问题可以有不同的答案。非持久性缓存(例如memoise可能需要单个分配,然后下面的答案是一个很好的方法。持久性缓存(例如R.cache)在会话中起作用,对于多个分配应该健壮。上述方法适用于R.cache。尽管进行了多次分配,但fn仅在R.cache时调用一次。它会被memoise调用两次。

> ProtoTester <- proto(
+     calc = function(.) {
+         fn <- function() print(runif(1))
+         invisible(memoizedCall(fn))
+     }      
+ )
> replicate(5, ProtoTester$calc())
[1] 0.977563
[1] 0.1279641
[1] 0.01358866
[1] 0.9993092
[1] 0.3114813
[1] 0.97756303 0.12796408 0.01358866 0.99930922 0.31148128
> ProtoTester <- proto(
+     calc = function(.) {
+         fn <- function() print(runif(1))
+         invisible(memoizedCall(fn))
+     }      
+ )
> replicate(5, ProtoTester$calc())
[1] 0.97756303 0.12796408 0.01358866 0.99930922 0.31148128

我认为我遇到R.cache问题的原因是我将proto方法作为函数传递给memoizedCallproto方法以R.cache很难处理的方式绑定到环境中。在这种情况下,您需要做的是取消绑定函数(从实例化方法获取到简单函数),然后手动传递对象作为第一个参数。以下示例显示了其工作原理(ReportReport$loader都是proto个对象:

# This will not memoize the call
memoizedCall(Report$loader$download_report)

# This works as intended
memoizedCall(with(Report$loader, download_report), Report$loader)

我很想知道为什么R.cache适用于绑定到环境但通过proto实例化方法失败的普通函数。

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

在您的代码中,每次调用该函数时都会重新记忆该函数。 以下内容应该有效:只有在定义时才会被记忆一次。

ProtoTester <- proto(
  calc = {
    fn <- function() print(runif(1))
    mfn <- memoise(fn)
    function(.) mfn()
  }
)
replicate(5, ProtoTester$calc())

答案 1 :(得分:3)

另一种解决方案是使用evals进行评估来自(我的)pander package,其中内部(临时在当前R会话的环境中持久存储磁盘存储)缓存引擎。基于代码的简短示例:

library(pander)
ProtoTester <- proto(
  calc = function(.) {
    fn <- function() runif(1)
    mfn <- evals('fn()')[[1]]$result
    invisible(mfn)
  }      
)

关闭并打开缓存后运行evals会导致:

> evals.option('cache', FALSE)
> replicate(5, ProtoTester$calc())
[1] 0.7152186 0.4529955 0.4160411 0.1166872 0.8776698

> evals.option('cache', TRUE)
> evals.option('cache.time', 0)
> replicate(5, ProtoTester$calc())
[1] 0.7716874 0.7716874 0.7716874 0.7716874 0.7716874

请注意,evals.option函数将很快重命名为evalsOption,以缓解有关S3方法的R CMD check警告。