快速访问DICOM图像中的像素值

Question

我正在尝试比较DICOM图像的数据集，以便我可以选择最适合opengl中体积渲染的数据集。我需要带有r，g，b和alpha通道的DICOM图像。

所以，基本上，我想在ubuntu中使用像irfanView这样的应用程序，我只需点击一个点就可以得到相应的像素信息。

我不想要一些像itk或dcmtk这样的c ++库。我不知道如何用imagemagick做同样的事情。有谁知道这样的申请？

取得一些进展： 我使用dcmtk（虽然我更喜欢带gui的东西）并使用这个命令：

$ dcmdump .dcm 一个巨大的输出看起来像：

DICOM的文件格式的

DICOM的元信息报头

使用的TransferSyntax：Little Endian明确 （0002,0002）UI = MRImageStorage＃26,1 MediaStorageSOPClassUID （0002,0010）UI = LittleEndianImplicit＃18,1 TransferSyntaxUID

DICOM的数据集 使用的TransferSyntax：Little Endian Implicit （0008,0005）CS [ISO_IR 100]＃10,1个SpecificCharacterSet （0008,0008）CS [ORIGINAL \ SECONDARY \ MPR]＃24,3 ImageType （0008,0016）UI = MRImageStorage＃26,1 SOPClassUID （0008,0018）UI [1.3.12.2.1107.5.2.4.7259.20010531113752000010358]＃48,1 SOPInstanceUID （0008,0020）DA [20010302]＃8,1 StudyDate

等......直到......

（7fe0,0010）OW 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 \ 0000 ......＃131072，1 PixelData

这是该输出中的最后一行。这是我正在寻找的信息。但是我如何提取完整的像素数据而不仅仅是它的一小部分样本呢？

Answer 1

我不知道任何具有此类功能的免费DICOM图像编辑器，因此我建议您分两步进行此操作：

• 使用工具将DICOM图像转储为常规图像格式，例如dcm2pnm DCMTK binary distribution（{3}}（至少Windows发行版）中的预编译二进制文件格式。
• 使用您喜欢的图像查看和编辑工具（例如IrfanView）来检查转储的图像。