从后缀树生成后缀

时间:2012-04-09 13:50:15

标签: algorithm data-structures suffix-tree

我已根据这里的网站http://marknelson.us/1996/08/01/suffix-trees/在Java中构建了一个后缀树,但我遇到了一个问题。我可以构建一个后缀树,但我可以尝试从树中构建一组所有后缀。我基本上找到所有'结束节点'并返回由'end node'

表示的字符串

该算法适用于像“簿记员”这样的单词

├── (1) bookkeeper
├── (9) e
│   ├── (8) eper
│   ├── (10) per
│   └── (12) r
├── (6) k
│   ├── (7) eeper
│   └── (5) keeper
├── (3) o
│   ├── (4) kkeeper
│   └── (2) okkeeper
├── (11) per
└── (13) r

后缀:

[bookkeeper, ookkeeper, okkeeper, kkeeper, keeper, eeper, eper, er, per, r]

但是当我使用像“ATATATATATA”这样的东西时它失败了

├── (1) ATATATATATA
└── (2) TATATATATA

后缀:

[ATATATATATA, TATATATATA]

但正确的后缀应该是:

[A, ATA, ATATA, ATATATA, ATATATATA, ATATATATATA, TA, TATA, TATATA, TATATATA, TATATATATA]

我可以通过查找每个“结束节点”字符串的所有后缀来找到答案,但这似乎不是正确的方法。还有其他建议吗?

编辑: 谢谢izomorphius!将END_CHAR添加到原始字符串有帮助。

├── (21) #
├── (19) A
│   ├── (20) #
│   └── (15) TA
│       ├── (16) #
│       └── (11) TA
│           ├── (12) #
│           └── (7) TA
│               ├── (8) #
│               └── (3) TA
│                   ├── (4) #
│                   └── (1) TA#
└── (17) TA
    ├── (18) #
    └── (13) TA
        ├── (14) #
        └── (9) TA
            ├── (10) #
            └── (5) TA
                ├── (6) #
                └── (2) TA#

后缀:

[A, ATA, ATATA, ATATATA, ATATATATA, ATATATATATA, TA, TATA, TATATA, TATATATA, TATATATATA]

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

关于如何构建后缀树的典型提示是添加一个你知道不在字母表中的人造角色。我通常添加'#'然后我为ATATATATATA#构建后缀树,这样你就不会再遇到这个问题了。

您遇到了您描述的问题,因为缺少的后缀实际上被视为另一个后缀的前缀。最后添加一个人工角色可确保永远不会发生这种情况。