使用ggplot2在每个因子内订购条形码

Question

我正在使用ggplot创建这个“barplot”，但我希望能够重新定位每个类别中的条形图，以便最高的条形图位于顶部。简而言之，每个类别都有一个从高到低排序。

以下是我的代码 - 欢迎任何提示 - 谢谢

library("ggplot2")
d <- read.csv('http://db.tt/EOtR3uh', header = F)

d$V4 <- factor(d$V2, levels=d$V2)
base_size <- 11
ggplot(d, aes(d$V4, -log10(d$V3), fill=d$V1)) +
geom_bar(stat="identity") +
coord_flip() +
labs(y = "-log10(Pvalues)",x = "",fill="") +
theme_grey(base_size = base_size) +
scale_x_discrete(expand = c(0, 0))

Answer 1

相应地对您的等级进行排序

d <- read.csv('http://db.tt/EOtR3uh', header = F, stringsAsFactors=FALSE)
lvls <- d$V2[order(d$V1,-d$V3)]
d$V4 <- factor(d$V2, levels=lvls)

Answer 2

实现同一目标的另一种方式

require(ggplot2)
d = arrange(d, V1, -V3)                             # arrange d by V1 and -V3
d = transform(d, V2 = factor(V2, as.character(V2))) # order V2 as in d

qplot(V2, -log10(V3), fill = V1, geom = 'bar', data = d) + 
  coord_flip() 

Answer 3

我在这里回答我的问题：

要改变的行是

d$V4 <- ordered(d$V2, levels=d$V2[order(d$V1,-d$V3)])

完整代码：

library("ggplot2")
d <- read.csv('http://db.tt/EOtR3uh', header = F)

d$V4 <- ordered(d$V2, levels=d$V2[order(d$V1,-d$V3)])
base_size <- 11
ggplot(d, aes(d$V4, -log10(d$V3), fill=d$V1)) +
geom_bar(stat="identity") +
coord_flip() +
labs(y = "-log10(Pvalues)",x = "",fill="") +
theme_grey(base_size = base_size) +
scale_x_discrete(expand = c(0, 0))