如何为Keras / tf.Keras构建自定义数据生成器,其中X图像被增强,相应的Y标签也是图像

时间:2020-09-10 10:04:39

标签: python tensorflow keras deep-learning tensorflow2.0

我正在使用UNet进行图像二值化,并且也有150个图像及其二值化版本的数据集。我的想法是随机放大图像,使它们看起来像不同,所以我制作了一个函数,可以将4-5种类型的噪波,偏度,剪切等中的任何一种插入到图像中。我本来可以轻松使用

ImageDataGenerator(preprocess_function=my_aug_function)来放大图像,但是问题是我的 y目标也是图像。另外,我本可以使用类似的东西:

train_dataset = (
    train_dataset.map(
        encode_single_sample, num_parallel_calls=tf.data.experimental.AUTOTUNE
    )
    .batch(batch_size)
    .prefetch(buffer_size=tf.data.experimental.AUTOTUNE)
)

但是它有两个问题:

  1. 对于更大的数据集,由于数据需要已经在内存中,因此它将耗尽内存
  2. 这是至关重要的部分,我需要在旅途中增加图像以使其看起来像我有一个庞大的数据集。

另一种解决方案是将增强图像保存到目录中,使其大小为30-40K,然后加载它们。这样做很愚蠢。

现在,最重要的部分是我可以使用Sequence作为父类,但是如何继续动态地使用各自的Y二值化图像来增强和生成新图像呢?

我有一个如下代码的想法。有人可以帮助我增强和生成y图像吗?我有X_DIR, Y_DIR,其中二值化图像和原始图像名称相同,但存储在不同目录中。

class DataGenerator(tensorflow.keras.utils.Sequence):
    def __init__(self, files_path, labels_path, batch_size=32, shuffle=True, random_state=42):
        'Initialization'
        self.files = files_path
        self.labels = labels_path
        self.batch_size = batch_size
        self.shuffle = shuffle
        self.random_state = random_state
        self.on_epoch_end()


    def on_epoch_end(self):
        'Updates indexes after each epoch'
        # Shuffle the data here


    def __len__(self):
        return int(np.floor(len(self.files) / self.batch_size))

    def __getitem__(self, index):
        # What do I do here? 


    def __data_generation(self, files):
        # I think this is responsible for Augmentation but no idea how should I implement it and how does it works.

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您可以使用诸如唱片化和imgaug之类的库,两者都很好,但我听说唱片化的随机种子存在问题。 以下是来自文档here的imgaug示例:

seq = iaa.Sequential([
    iaa.Dropout([0.05, 0.2]),      # drop 5% or 20% of all pixels
    iaa.Sharpen((0.0, 1.0)),       # sharpen the image
    iaa.Affine(rotate=(-45, 45)),  # rotate by -45 to 45 degrees (affects segmaps)
    iaa.ElasticTransformation(alpha=50, sigma=5)  # apply water effect (affects segmaps)
], random_order=True)

# Augment images and segmaps.
images_aug = []
segmaps_aug = []
for _ in range(len(input_data)):
    images_aug_i, segmaps_aug_i = seq(image=image, segmentation_maps=segmap)
    images_aug.append(images_aug_i)
    segmaps_aug.append(segmaps_aug_i)

您将以正确的方式使用自定义生成器。在__getitem__中,使用batch_x = self.files[index:index+batch_size]进行批量处理,并使用batch_y进行批量处理,然后使用X,y = __data_generation(batch_x, batch_y)对其进行扩充,这将加载图像(使用您喜欢的任何库,我更喜欢opencv),并返回增强对(和其他任何操作)。

您的__getitem__然后将返回元组(X,y)

答案 1 :(得分:0)

即使标签是图像,也可以使用ImageDataGenerator。 这是一个简单的示例,说明如何实现:

代码:

# Specifying your data augmentation here for both image and label
image_datagen = tf.keras.preprocessing.image.ImageDataGenerator()
mask_datagen = tf.keras.preprocessing.image.ImageDataGenerator()

# Provide the same seed and keyword arguments to the flow methods
seed = 1
image_generator = image_datagen.flow_from_directory(
    data_dir,
    class_mode=None,
    seed=seed)
mask_generator = mask_datagen.flow_from_directory(
    data_dir,
    class_mode=None,
    seed=seed)

# Combine the image and label generator.
train_generator = zip(image_generator, mask_generator)

现在,如果您对其进行迭代,将得到:

for image, label in train_generator:
  print(image.shape,label.shape)
  break

输出:

(32, 256, 256, 3) (32, 256, 256, 3)

您可以通过fit()命令使用此train_generator。

代码:

model.fit_generator(
    train_generator,
    steps_per_epoch=2000,
    epochs=50)

有了flow_from_directory,您的记忆将不会混乱,Imagedatagenerator将负责扩充部分。