将NIFTI图像分割为体素补丁

Question

我正在尝试将一组3D MRA NIFTI图像分割成大小相等（例如32 x 32 x 32）的体素块。
目的是使用体素训练3D CNN以检测脑动脉内的异常情况。

如何通过Python使用像Numpy这样的库来实现这一点。

Answer 1

我的回答是：

1. 您必须找到 ROI ，并在其周围切一个尺寸为 32x32 的正方形。

   • 请注意，您的ROI可能要小于您要处理的区域，因此请检查它是否适合所有数据库图像。

2. 对于最后一个维度，请执行 padding （填充为零）（例如零填充）以填充其余切片以获得32切片，因此结果是32x32裁剪的图像x 32切片。

   • 请注意，切片数不能超过32的体素。
   • 最终结果将是：

     32 x 32 x 32