需要使用仅NA的数据创建ggplot热图,但会出现“错误:必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”

时间:2020-01-02 19:50:03

标签: r ggplot2 heatmap

我需要创建一个单行热图,偶尔会从仅NA列派生,但无论如何都必须显示。在下面的示例中,从p2列生成热图将呈现“错误:必须从色调调色板中请求至少一种颜色。”。有什么方法可以强制ggplot显示“空”热图?

library(ggplot2)
id <- letters[1:5]
p1 <- factor(c(1,NA,2,NA,3))
p2 <- factor(c(NA,NA,NA,NA,NA))
dat <- data.frame(id=id, p1=p1, p2=p2)

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p1), colour = "white") #works fine

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + geom_tile(aes(fill = p2), colour = "white") #renders error

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

我认为,如果您在ggplot调用中使用NA明确告诉na.value如何处理scale_fill_manual值。这样可以解决您的问题,或者至少可以引导您朝正确的方向前进:

ggplot(dat, aes(x=id,y="identity")) + 
  geom_tile(aes(fill = p2), colour = "white") + 
  scale_fill_manual(values = "white", 
                    na.value = "black") 

您可以更改values参数以更好地处理您喜欢的颜色