具有NA值的热图

时间:2019-09-18 14:58:06

标签: r heatmap na col hcluster

我试图绘制一个热图,但是在矩阵中我有一堆NA。我不想丢掉整行,所以我在这里寻找解决方案。 第一个错误是外部函数调用(参数11)中的NA / NaN / Inf。我认为hcluster无法使用Na数据。如何添加一些中断并将NA标记为黑色。我尝试了代码

my_palette <- colorRampPalette(c("yellow", "orange", "red")) (n=20)
breaks <- seq(min(treatment.matrix, na.rm = T), max(treatment.matrix, na.rm = T), length.out=21)
heatmap.2(treatment.matrix, trace="none", na.color = "black", scale="none", col = my_palette, breaks=breaks)

但是发生了同样的错误。 请帮忙。谢谢。

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