无法在IBM DSX R环境笔记本电脑上安装CRAN软件包“viridis”,“Hmisc”

时间:2018-03-01 21:29:30

标签: r jupyter-notebook cran data-science-experience hmisc

我正在尝试在IBM DSX上的R Environment Notebook中安装CRAN Hmisc包。但它反复失败,出现以下错误:

install.packages('Hmisc')

also installing the dependencies ‘checkmate’, ‘rstudioapi’, ‘Formula’, ‘latticeExtra’, ‘acepack’, ‘gridExtra’, ‘htmlTable’, ‘viridis’

Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘Hmisc’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

我尝试单独安装viridis软件包,但也失败并出现同样的错误:

install.packages('viridis')

Warning message in install.packages("viridis"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我所做的是使用devtools下载某个版本的库:

require(devtools)
install_version('Hmisc',  version = "4.1-0")

然后我再次安装它:

install.package('Hmisc')

然后,您可以加载库library('Hmisc')并运行sessionInfo()以查看您是否正在运行最新版本。这是一种解决方法,我不知道为什么它最初不想安装。也许它与使用版本3.3.2的DSX中的R有关,并且缺少一些库?我还没有线索。

答案 1 :(得分:0)

事实证明,viridis上的依赖管理不正确。它具有viridisLite >= 0.2.0的依赖性。最新的viridis期待一个名为cividis的对象,该对象仅在最新版本的viridisLite > 0.2.0上添加。 DSX已安装viridisLite==0.2.0。因此,viridis的安装失败。所以基本上,明确安装较新版本的viridisLite可以解决问题。

install.packages(c('viridisLite', 'Hmisc'))

TL; DR - 安装最新的viridisLite,然后安装Hmisc