Python中的生命线布尔索引与维度0的索引数组不匹配;维度为88但对应的布尔维度为76

Question

这段非常简单的代码，

# imports...
from lifelines import CoxPHFitter
import pandas as pd

src_file = "Pred.csv"

df = pd.read_csv(src_file, header=0, delimiter=',')
df = df.drop(columns=['score'])

cph = CoxPHFitter()
cph.fit(df, duration_col='Length', event_col='Status', show_progress=True)

产生错误：

  

追踪（最近一次通话）：   文件   “C：/ Users /.../ predictor.py”，第11行，   在       cph.fit（df，duration_col ='Length'，event_col ='Status'，show_progress = True）

     

文件   “C：\用户\ ... \应用程序数据\本地\畅达\畅达\ ENVS \ hrpred \ LIB \站点包\ \生命线钳工\ coxph_fitter.py”   第298行，合适       self._check_values（DF）

     

文件“C：\ Users \ ... \ AppData \ Local \ conda \ conda \ envs \ hrpred \ lib \ site-packages \ lifelines \ fitters \ coxph_fitter.py”，   第_ 323行，在_check_values中       cols = str（list（X.columns [low_var]））

     

文件“C：\ Users \ ... \ AppData \ Local \ conda \ conda \ envs \ hrpred \ lib \ site-packages \ pandas \ core \ indexes \ base.py”，   第1754行，在_ _ getitem _ _

     

result = getitem（key）

     

IndexError：布尔索引与维度0的索引数组不匹配;尺寸为88但对应   布尔维度为76

然而，当我打印 df 本身时，一切都很好。如您所见，一切都在图书馆内。图书馆的例子很好用。

Answer 1

在不知道你的数据是什么样的情况下 - 我有同样的错误，当我从大熊猫df中删除了所有但持续时间，事件和系数时，我已经解决了这个问题。也就是说，我在df中有很多额外的列混淆了cox PH fitter，因为你实际上没有指定你想要包含哪个coef作为cph.fit（）的参数。