我使用
为R中的数据拟合了平滑样条曲线library(splines)
Model <- smooth.spline(x, y, df =6)
我想采用拟合样条曲线并在外部代码（不在R中）中对任意新数据进行评估。换句话说，执行predict.smooth.spline函数的功能。我查看了Model对象：
> str(Total_work_model)
List of 15
$ x : num [1:14] 0.0127 0.0186 0.0275 0.0343 0.0455 ...
$ y : num [1:14] 3174 3049 2887 2862 2975 ...
$ w : num [1:14] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ yin : num [1:14] 3173 3075 2857 2844 2984 ...
$ data :List of 3
..$ x: num [1:14] 0.0343 0.0455 0.0576 0.0697 0.0798 ...
..$ y: num [1:14] 2844 2984 3048 2805 2490 ...
..$ w: num [1:14] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ lev : num [1:14] 0.819 0.515 0.542 0.568 0.683 ...
$ cv.crit : num 6494075
$ pen.crit: num 3260
$ crit : num 3
$ df : num 8
$ spar : num 0.353
$ lambda : num 8.26e-05
$ iparms : Named int [1:3] 3 0 10
..- attr(*, "names")= chr [1:3] "icrit" "ispar" "iter"
$ fit :List of 5
..$ knot : num [1:20] 0 0 0 0 0.056 ...
..$ nk : int 16
..$ min : num 0.0127
..$ range: num 0.104
..$ coef : num [1:16] 3174 3132 3027 2871 2842 ...
..- attr(*, "class")= chr "smooth.spline.fit"
$ call : language smooth.spline(x = Phi00, y = Total, df = 8)
- attr(*, "class")= chr "smooth.spline"
我认为Model$fit$knot和Model$fit$coef向量包含拟合的完整描述。请注意，结是20，而x和y每个都有14个元素：我一直认为平滑样条曲线具有与拟合点一样多的结。但是，由于前三个和后三个结是相同的，因此20-6 = 14是有意义的。问题是我不知道如何使用Model$fit$knot和Model$fit$coef在R之外做出预测。我试着看看predict.smooth.spline，但令人惊讶的是，＆＃39;我得到了什么
> library(splines)
> predict.smooth.spline
Error: object 'predict.smooth.spline' not found
编辑：因为显然有些用户误解了这个问题，我知道如何在R中使用predict来获取平滑样条曲线的新值。问题是我想在外部代码中进行这些预测。因此，我想查看函数predict.smooth.spline的代码，以便我可以尝试在R之外重现算法。通常在R中，您只需输入其名称即可读取函数的代码（不带参数）在R提示下，没有括号。但是当我尝试使用predict.smooth.spline时，我得到了上述错误。
EDIT2：感谢@ r2evans的大力帮助，我找到了predict smooth.spline方法的来源。我（我想）理解其中的大部分内容：
> stats:::predict.smooth.spline.fit
function (object, x, deriv = 0, ...)
{
if (missing(x))
x <- seq.int(from = object$min, to = object$min + object$range,
length.out = length(object$coef) - 4L)
xs <- (x - object$min)/object$range
extrap.left <- xs < 0
extrap.right <- xs > 1
interp <- !(extrap <- extrap.left | extrap.right)
n <- sum(interp)
y <- xs
if (any(interp))
y[interp] <- .Fortran(C_bvalus, n = as.integer(n), knot = as.double(object$knot),
coef = as.double(object$coef), nk = as.integer(object$nk),
x = as.double(xs[interp]), s = double(n), order = as.integer(deriv))$s
if (any(extrap)) {
xrange <- c(object$min, object$min + object$range)
if (deriv == 0) {
end.object <- Recall(object, xrange)$y
end.slopes <- Recall(object, xrange, 1)$y * object$range
if (any(extrap.left))
y[extrap.left] <- end.object[1L] + end.slopes[1L] *
(xs[extrap.left] - 0)
if (any(extrap.right))
y[extrap.right] <- end.object[2L] + end.slopes[2L] *
(xs[extrap.right] - 1)
}
else if (deriv == 1) {
end.slopes <- Recall(object, xrange, 1)$y * object$range
y[extrap.left] <- end.slopes[1L]
y[extrap.right] <- end.slopes[2L]
}
else y[extrap] <- 0
}
if (deriv > 0)
y <- y/(object$range^deriv)
list(x = x, y = y)
}
但是，我有两个困难：
.Fortran()函数调用Fortran子例程bvalus，其source非常简单。但是，bvalus依次调用bvalue，而complicated更多interv，并调用我无法找到其来源的bvalue。坏消息：predict.smooth.spline.fit对我来说太复杂了（我绝对不是Fortran专家）。好消息：必须重现bvalus的外部代码也是Fortran代码。如果情况变得更糟，我可以让我的同事在他的代码中包含来自bvalue和interv的来源。然而，即使在这个确实不太好的情况下，我仍然会错过deriv == 0的源代码（我希望它不会调用别的东西!!!）。
我不明白这里做了什么（注意我只对 if (any(extrap)) {
xrange <- c(object$min, object$min + object$range)
if (deriv == 0) {
end.object <- Recall(object, xrange)$y
end.slopes <- Recall(object, xrange, 1)$y * object$range
if (any(extrap.left))
y[extrap.left] <- end.object[1L] + end.slopes[1L] *
(xs[extrap.left] - 0)
if (any(extrap.right))
y[extrap.right] <- end.object[2L] + end.slopes[2L] *
(xs[extrap.right] - 1)
}
案例感兴趣）：
ķ
activity某种递归代码？这里有什么帮助吗？
答案 0 :(得分：2)
smooth.spline不在splines包中，而是在stats中。此外，它未导出，因此您必须使用三重冒号方法来查看它：stats:::predict.smooth.spline。然后它会指向predict.smooth.spline.fit，可以以类似的方式找到它。 （由于它可选择使用.Fortran()，您可能需要推断正在发生的事情......除非您深入研究the source。）
答案 1 :(得分：1)
将平滑样条导出为分段多项式是在R外部重构样条的一种方法。我的包SplinesUtils：https://github.com/ZheyuanLi/SplinesUtils可以做到这一点。你可以通过
devtools::install_github("ZheyuanLi/SplinesUtils")
此处要使用的功能是SmoothSplinesAsPiecePoly。我只是在其文档中复制此功能的示例。
library(SplinesUtils)
## a toy dataset
set.seed(0)
x <- 1:100 + runif(100, -0.1, 0.1)
y <- poly(x, 9) %*% rnorm(9)
y <- y + rnorm(length(y), 0, 0.2 * sd(y))
## fit a smoothing spline
sm <- smooth.spline(x, y)
## coerce "smooth.spline" object to "PiecePoly" object
oo <- SmoothSplineAsPiecePoly(sm)
## print the "PiecePoly"
oo
#61 piecewise polynomials of degree 3 are constructed!
#Use 'summary' to export all of them.
#The first 6 are printed below.
#-0.626 - 0.17 * (x - 1.08) - 0 * (x - 1.08) ^ 2 - 0.0094 * (x - 1.08) ^ 3
#-0.768 - 0.148 * (x - 1.95) - 0.0246 * (x - 1.95) ^ 2 - 0.00569 * (x - 1.95) ^ 3
#-0.919 + 0.0259 * (x - 4.01) + 0.0598 * (x - 4.01) ^ 2 + 0.0086 * (x - 4.01) ^ 3
#-0.834 + 0.124 * (x - 5.08) + 0.0323 * (x - 5.08) ^ 2 + 0.00466 * (x - 5.08) ^ 3
#-0.494 + 0.197 * (x - 7.08) + 0.00433 * (x - 7.08) ^ 2 + 0.0027 * (x - 7.08) ^ 3
#-0.113 + 0.183 * (x - 9.03) + 0.0115 * (x - 9.03) ^ 2 + 0.00377 * (x - 9.03) ^ 3
样条线的结点
oo$knots
# [1] 1.079339 1.953102 4.014571 5.081642 7.079678 9.032160
# [7] 10.025823 11.941195 12.935311 14.976821 16.999540 18.043524
#[13] 19.976007 22.086941 22.942429 24.925111 25.953444 27.902678
#[19] 30.073938 30.968070 33.019913 34.937244 36.065475 38.058848
#[25] 38.921589 40.982255 43.029412 44.056587 46.005944 47.904666
#[31] 48.995446 51.038546 51.995524 53.987619 55.914136 56.919893
#[37] 59.003727 60.981366 62.082575 63.991813 64.966479 66.951603
#[43] 69.053262 69.916849 71.967815 73.969337 74.966755 77.078440
#[49] 78.072868 80.055464 81.986932 83.042503 84.965070 86.940538
#[55] 88.042224 89.949098 90.928661 92.911787 95.075254 96.055783
#[61] 97.991055 100.062174
分段多项式系数为
CoefMat <- oo$PiecePoly$coef
## for the first 5 pieces
CoefMat[, 1:5]
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
#[1,] -0.626225456 -0.768321912 -0.919380838 -0.83408278 -0.494257767
#[2,] -0.169805245 -0.148267472 0.025888868 0.12418698 0.197353171
#[3,] 0.000000000 0.024649465 0.059832206 0.03228737 0.004331680
#[4,] 0.009403574 0.005688943 -0.008604501 -0.00466386 -0.002702257
该软件包还具有其他功能。有关示例，请参见Identify all local extrema of a fitted smoothing spline via R function 'smooth.spline'。